分子动力学模拟配置更换问题：i5 12490f VS 双路E5 2680V4

樊樊樊

各位老师好，我想请问一下分子动力学模拟配置相关的几个小问题：
1. 主要模拟对象：多肽，膜，大分子蛋白质如胶原蛋白等之间的相互作用。2. 目前配置：I5 12490f+4060ti 16g+dr 16g*2 3200mhz的配置
3. 想更换配置：考虑到CPU的耐用性和现目前内存大小的限制，我想将CPU换为：双路E5 2680V4+D4 32g*4 2133mhz
4. 问题：
（1）请问按照这么考虑的话，稳定性和性能相比于12490f这个u，会有提升吗？
因为我在上科音的gromacs培训班的时候，里面有提到计算化学的瓶颈就是浮点运算能力。

我问了一下gpt双路和12490f的浮点运算能力差别
双路E5：FP64双精度：~1.3 TFLOPS（总计），FP32单精度：~2.6 TFLOPS（总计）
12490：FP32单精度：~0.85 TFLOPS（现代架构效率高），FP64双精度：相对较弱（Intel消费级U优化较少）
（2）这个升级有必要吗？
感谢各位老师的解答。

sobereva

GPU加速看重单核心能，E5 2680V4完全拖后腿。你又不是用CPU为主做计算。

tonganlhy

你这个换cpu要连主板一起换了，预算不会少。另外你要搞清楚浮点运算时依靠显卡而不是靠cpu，所以查cpu的浮点运算没有意义。用显卡搞分子动力学CPU的单核性能不能太弱，否则显卡性能不能充分发挥。你这个钱不如拿来升级内存和显卡。显卡现在4070 ti super性价比很高。比你4060ti单精度浮点性能翻倍。

樊樊樊

tonganlhy 发表于 2025-7-11 12:57
你这个换cpu要连主板一起换了，预算不会少。另外你要搞清楚浮点运算时依靠显卡而不是靠cpu，所以查cpu的浮 ...

明白了，感谢老师

樊樊樊

sobereva 发表于 2025-7-10 23:24
GPU加速看重单核心能，E5 2680V4完全拖后腿。你又不是用CPU为主做计算。

明白了sob老师，我准备升级GPU