计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 148|回复 Reply: 4
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 请教各位老师关于二面角图示的相关问题

[复制链接 Copy URL]

74

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1155

Level 4 (黑子)

本帖最后由 Fencros7y 于 2025-7-16 10:24 编辑

这里指的是一个分子结构中的两个芳环所在的平面形成的夹角,我希望画出如附件所示的效果,请问各位老师没有没哪个软件可以生成这样的图并且给出相应二面角的具体数值?

gmcl_a_2296156_f0002_c.jpg (160.12 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

gmcl_a_2296156_f0002_c.jpg

252

帖子

0

威望

1629

eV
积分
1881

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2025-7-16 10:24:34 | 只看该作者 Only view this author
有没有现成的软件不知道,但是这个图的平面看起来就是手动画了两个平面上去,二面角自行拟合一下两个环所在的平面就好了

120

帖子

0

威望

2209

eV
积分
2329

Level 5 (御坂)

#未来可寄

3#
发表于 Post on 2025-7-16 10:36:21 | 只看该作者 Only view this author
Mercury可以实现。可以根据一系列原子自定义平面,然后测量二面角

Mercury_measure_angle.png (107.66 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

Mercury_measure_angle

Mercury_measure_angle

74

帖子

0

威望

1081

eV
积分
1155

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-7-16 10:59:52 | 只看该作者 Only view this author
QuantumicGuy 发表于 2025-7-16 10:36
Mercury可以实现。可以根据一系列原子自定义平面,然后测量二面角

感谢老师,我这就去试试

6万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
120060

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2025-7-16 12:01:43 | 只看该作者 Only view this author
下文介绍的功能里,Multiwfn可以产生VMD里绘制特定平面的命令。对两个平面各运行一次,把产生的VMD命令一起放到VMD里运行就可以得到这种图
使用Multiwfn巨方便地绘制二维NICS平面图考察芳香性
http://sobereva.com/682http://bbs.keinsci.com/thread-39020-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2025-8-12 18:14 , Processed in 0.168292 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list