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[新手求助] 两个C60和一个Mg结构的过渡态优化耗时过长

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本帖最后由 莫思雨 于 2025-8-10 22:12 编辑

Gaussian计算含有两个C60和一个Mg结构的过渡态,算了六天还只算完第一个SCF循环,输入文件和结构见图,可能是哪里出了问题,怎么修改输入能让它正常算,是不是把QC删了。另:输入文件的其他设置是否合理?如何在不影响精度的情况下提高过渡态优化速度?

屏幕截图 2025-08-10 145556.png (26.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

gjf文件开头

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结构.png (167.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

初始结构

初始结构

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发表于 Post on 前天 16:19 | 只看该作者 Only view this author
没事甭用QC,更是绝对不要当成默认带的关键词,下文明确说了
解决SCF不收敛问题的方法
http://sobereva.com/61

没有输出文件,没法判断当前是什么情况,8成你描述得根本不对
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 22:36 | 只看该作者 Only view this author
任务在我看的时候还在运行,没有停止报错,觉得算太久就取消了。我在链接里放过out文件,但是你没有看到,那就是没有上传成功。out文件查找SCF Done长这样:
Linear equations converged to 1.973D-09 1.973D-08 after    23 iterations.
Angle between quadratic step and gradient=  62.38 degrees.
     ILin= 1 X=0.000D+00 Y=-4.771129241220D+03 DE= 0.00D+00 F= -2.80D-07
RMSU=  4.14D-07    CP:  1.00D+00  5.89D-01  7.02D-01 -3.00D+00 -3.00D+00
                    CP:  3.00D+00  2.09D+00 -3.00D+00  3.00D+00  3.00D+00
                    CP:  9.55D-01
     ILin= 2 X=1.000D+00 Y=-4.771129241363D+03 DE=-1.43D-07
Iteration  13 EE= -4771.12924136307     Delta-E=       -0.000000143140 Grad=4.367D-07 Max rot=    0.0000 deg.
Rotation gradient small -- convergence achieved.
SCF Done:  E(UCAM-B3LYP) =  -4771.12924136     a.u. after   13 cycles
            Convg  =    0.4367D-06                    74 Fock formations.
              S**2 =  2.0581                  -V/T =  2.0031
<Sx>= 0.0000 <Sy>= 0.0000 <Sz>= 1.0000 <S**2>= 2.0581 S= 1.0192
<L.S>= 0.000000000000E+00
Annihilation of the first spin contaminant:
S**2 before annihilation     2.0581,   after     2.0024
Leave Link  508 at Sun Aug  3 14:25:08 2025, MaxMem= 13421772800 cpu:    290424.2
(Enter /public/app/g09/l801.exe)
这样子第一个SCF应该是收敛的?需要out文件的其他部分我也可以发

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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 22:41 | 只看该作者 Only view this author
另:谢谢,我已经提交了去掉qc的任务,看看它的效果

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发表于 Post on yesterday 15:12 | 只看该作者 Only view this author
这结构是对应什么反应过渡态,Mg单电子转移还原C60、然后两个C60自由基负离子成碳碳键而偶联为带两个负电荷的二聚体?现实中真有这样的化学过程、而且确定是走单步基元反应的机理么?为什么自旋多重度是3而不是1?为什么泛函用的是CAM-B3LYP而不是计算量更小且普遍适用性也不错的原始B3LYP?

输出文件没上传成功可能是尺寸太大了,建议打包压缩再上传为帖子附件,或者用第三方网盘分享。
√546=23.36664289109

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发表于 Post on 14 hour ago | 只看该作者 Only view this author
莫思雨 发表于 2025-8-10 22:36
任务在我看的时候还在运行,没有停止报错,觉得算太久就取消了。我在链接里放过out文件,但是你没有看到, ...

你发完帖子你自己(而不是只有我)都没看到out文件,当然就是没上传成功。仔细看置顶的社员必读贴了解怎么上传文件、上传文件的规则,认识到上传较大文本文件时压缩的必要性
没有完整out文件没法判断情况。大概率之前已经算了很多了(因此才会导致输出文件超过500KB而无法在不压缩的情况下直接上传),只不过你没意识到、没交代出来。所以我要求必须有完整的out文件,省得浪费时间猜
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