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[新手求助] 求助1,2-苯醌氧化亚砷酸的反应计算细节问题

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本帖最后由 2877321934 于 2025-8-23 16:55 编辑

各位老师,我在计算1,2-苯醌氧化H3AsO3,生成儿茶酚和H2AsO4-的过程(砷酸和亚砷酸的质子化状态是从实验条件的的PH=5确定的),我推测的机理及计算流程如下(所有示意图均未经优化,纯手摆以作示意):如图为反应的初始状态,由左侧的1,2-苯醌,一个参与反应的水分子(序号20,21,22)和一个亚砷酸(序号13-19),没经过优化,图示为手摆结构 ,首先水分子上的22号H向1,2-苯醌氧化亚砷酸上的11号O迁移,与此同时水分子上的20号O与13号As成键,形成C6H4O2(H)和As(OH)4-,如下图 ,接着与As连接的OH(序号14,15)上的15号H向12号O迁移,此时已经生成儿茶酚和H3AsO4,如下图 。整个过程看着比较顺利,但我还是产生了两个疑问:1:根据实际PH,最终形态的砷酸应该是H2AsO4-形态,但我能拆出的基元反应得到的产物为H3AsO4,这里是否需要在最后多算这么一步:再引入一个水分子让H3AsO4上的H迁移到水分子上,得到H2AsO4-。2:这个反应明显是个氧化还原反应,中间的电荷转移过程仅仅通过搜寻过渡态就能描述清楚嘛?是否需要Marcus理论计算呢?先前有了解过Marcus理论用于计算没有共价键生成消失的电荷转移过程,这里似乎不适用,但还是有点不太放心。
The end.

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发表于 Post on 2025-8-23 18:49:27 | 只看该作者 Only view this author
1. 不算也可以,可以引用H3AsO4的实验pKa,然后说根据实验的pKa,之后还有一步H3AsO4变成H2AsO4-,就行了。毕竟这一步不是你的重点,对于足够不重要、不算也完全知道怎么进行的反应,可以不算
2. 当且仅当反应以电子转移为主,原子核没有大幅运动的时候,需要用Marcus理论。Marcus理论解决的是那些主要由电子运动驱动,因此没有明确的过渡态的反应的速率计算,不管是电子转移、能量转移、ISC或是其他过程,并非限于电子转移
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-8-25 13:20:12 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2025-8-23 18:49
1. 不算也可以,可以引用H3AsO4的实验pKa,然后说根据实验的pKa,之后还有一步H3AsO4变成H2AsO4-,就行了。 ...

好的,感谢老师的详细解答!
The end.

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