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[GROMACS] GROMACS安装警告以及后续的安装失败

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本帖最后由 CCLI 于 2025-9-15 16:04 编辑

各位老师好!我安装GROMACS是遇到了一些困难和困惑。按照GROMACS的安装方法(含全程视频演示) - 分子模拟 (Molecular Modeling) - 计算化学公社教程,我在执行cmake3 .. -DCMAKE_INSTALL_PREFIX=/sob/gmx2018.8。出现提示,有些好像涉及显卡问题,有些事显示cmake版本高了,部分模块用不了,但我又不会操作。最后执行make install -j,显示报错(见第一张图片),前面的提示会不会导致后面安装的不顺利?我电脑的系统为rocky Linux10,gcc版本为14.2.1,cmake3版本为3.30.5,安装版本为gromacs-2018.8。

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发表于 Post on 2025-9-15 17:57:33 | 只看该作者 Only view this author
有没有NVIDIA显卡?有的话,有没有正确安装驱动及相容的CUDA toolkit?
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2025-9-15 18:06:13 | 只看该作者 Only view this author
你尝试一下仔细读读那个帖子的内容,里面有讲到安装2018.8会遇到的问题。
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2025-9-16 04:15:18 | 只看该作者 Only view this author
你若要做GPU加速计算,甭用2018,性能远不如近期的gmx版本。而且由于gcc版本太新可能编译失败
2018版需要留一个备用,但可以直接用我编译的windows版2018,不需要自己编译,本来也不会用2018版跑高耗时的任务
GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法(支持GPU加速)
http://sobereva.com/458http://bbs.keinsci.com/thread-11848-1-1.html

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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-16 09:00:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-16 04:15
你若要做GPU加速计算,甭用2018,性能远不如近期的gmx版本。而且由于gcc版本太新可能编译失败
2018版需要 ...

好的,谢谢老师

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-16 09:02:47 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2025-9-15 17:57
有没有NVIDIA显卡?有的话,有没有正确安装驱动及相容的CUDA toolkit?

有50系显卡,但打算只用cpu计算

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