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[Multiwfn使用咨询] 怎么让Multiwfn计算ESP时候输出的vtx.pdb文件B因子的单位固定为kcal/mol或者eV

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楼主
如题:怎么让Multiwfn计算ESP时候输出的vtx.pdb文件B因子的单位固定为kcal/mol或者eV
我导入两个分子计算,一个输出单位是kcal/mol,一个是eV,但是想放到同一张图里比较,应该怎么处理呢

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发表于 Post on 2025-9-10 22:23:44 | 只看该作者 Only view this author
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva.com/443http://bbs.keinsci.com/thread-11080-1-1.html
用上文说的iso方式绘图
或者如果非要每个表面顶点信息,Multiwfn主功能12后处理菜单的选项8导出vtx.pqr,由于不受pdb的B因子记录格式宽度的限制,所有所有情况单位都统一
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-11 22:04:09 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 NEW12138 于 2025-9-11 22:13 编辑
sobereva 发表于 2025-9-10 22:23
使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)
http://sobereva. ...

老师,我导出这个文件后,用VMD作图发现color method选择beta图像直接没有了,我看您关于局部静电势展现的帖子说要在 select atom栏改成resid 1,color method选择charge。1. 请问我整个分子要改select atom吗,2. 我在color method选择charge后出现了渐变的分布,请问这个值的范围我是以pqr文件的倒数第三列为准吗,因为我发现trajectory 里auto set的范围和pqr文件里实际的最大最小不一致,所以想再确认一下,3. 请问这个值的单位是a.u.吗
麻烦老师了,谢谢

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发表于 Post on 2025-9-12 13:42:51 | 只看该作者 Only view this author
NEW12138 发表于 2025-9-11 22:04
老师,我导出这个文件后,用VMD作图发现color method选择beta图像直接没有了,我看您关于局部静电势展现 ...

pqr文件用的是charge那一列记录的静电势,和pdb文件不一样,仔细看导出pqr文件时候Multiwfn在屏幕上非常清楚的提示

你若想绘制整个分子的当然selected atoms用默认的all

是a.u.,仔细看Multiwfn导出文件时始终在屏幕上超级清楚的提示
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-9-12 15:31:21 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-9-12 13:42
pqr文件用的是charge那一列记录的静电势,和pdb文件不一样,仔细看导出pqr文件时候Multiwfn在屏幕上非常 ...

好的,谢谢老师,是我没有仔细看清楚

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