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[波函数分析求助] IRI散点图戳底尖端与IRI图以及AIM键径归属不明

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本帖最后由 Voidmio 于 2025-10-6 17:17 编辑

前日对一对儿较大体系进行了IRI分析,格点精度 500*500*500,绘制了散点图和等值面cub,同时进行了AIM分析。

其中一体系的AIM键径-IRI等值面图和IRI散点图如下:


针对IRI图以及化学常识绘制的结构简式和CYLview标明原子距离如下,以方便大家参考:


可见散点图中小于0.015的部分明显有三处戳底的尖端,但明显的氢键作用在图中只能分析到这两处(我画出的)(同时 BCP 计算二者能量分别为-3.6和-1.6 kcal/mol),难以归属为散点图中的三个尖峰。

这是为什么呢,求各位老师指教



p.s. 类似的另一个体系也进行了分析,似乎符合得比较好,同样体系里也看不到其他的蓝绿青色区域了:

这种分析和归属是否合理呢

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发表于 Post on 2025-10-6 18:44:16 | 只看该作者 Only view this author
散点图根本没什么用,甭管它

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Voidmio + 5 好萌好萌好萌!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-7 22:35:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-6 18:44
散点图根本没什么用,甭管它

谢谢sob!
还想问问,比如对于我图中这种体系,是否可以通过 J. Comput. Chem., 40, 2868-2881 (2019) 中的拟合结果进行氢键键能的预测呢,需要用中性还是带电荷体系的拟合式呢?

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发表于 Post on 2025-10-8 07:20:39 | 只看该作者 Only view this author
Voidmio 发表于 2025-10-7 22:35
谢谢sob!
还想问问,比如对于我图中这种体系,是否可以通过 J. Comput. Chem., 40, 2868-2881 (2019)  ...

可以算原子电荷,如果形成氢键那个局部区域类似于JCC文中带电氢键的情况,就用带电氢键的公式,否则用中性的公式

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Voidmio + 5 谢谢

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