|
|
求助!ORCA版本6.1.0,OpenMPI 4.1.8,MacOS 15.6.1。在计算IRC时得到以下的错误信息:
## A system call failed during shared memory initialization that should
not have. It is likely that your MPI job will now either abort or
experience performance degradation.
Local host: YuhangdeMacBook-Pro.local
System call: unlink(2) /var/folders/sj/6pnb_30n0155cbzdtz6d7jg00000gn/T//ompi.YuhangdeMacBook-Pro.501/pid.57532/1/vader_segment.YuhangdeMacBook-Pro.501.21ff0001.10
Error: No such file or directory (errno 2)
[YuhangdeMacBook-Pro.local:57532] 1 more process has sent help message help-opal-shmem-mmap.txt / sys call fail
[YuhangdeMacBook-Pro.local:57532] Set MCA parameter "orte_base_help_aggregate" to 0 to see all help / error messages
这段信息在开始计算Forward时反复出现,导致没有进行任何一个点的IRC的结构计算,直到最后报错退出。当我进行其他的IRC任务时也会出现相同的错误。需要注意的是,我在进行其他类别的任务时(如普通的opt+freq)也会在terminal中发现这段报错信息,但是计算在持续进行没有报错退出,并且能得到正确的结果。目前为止只有IRC计算时会得到报错退出的结果。
我在禁用Vader后确实可以正常运行并得到正确的计算结果了,但是用任务管理器查看后台时发现后台的“系统”占用大幅提升至40%~50%,而“用户”占用降低(总占率,即为二者之和,依旧几乎为100%),而且这种现象可以在禁用Vader时复现在其他计算任务中。在禁用Vader前则是“用户”的占用永远在90%以上,“系统”占用几乎可以忽略不计。这是因为禁用Vader后“系统”因为分配内存的运算而提高了占用吗?这会影响计算效率吗?
我该如何彻底解决这个问题呢?如果不禁用Vader的话该如何操作呢?谢谢大佬们的指教! |
|