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[GROMACS] 运行Gromacs报错“top文件的atomtype顺序无效”

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本帖最后由 璃陌51129 于 2025-10-18 21:57 编辑

我是理论计算小白,目前在自学GROMACS,模拟的体系是电解液,根据相关论坛帖子做了一些工作,但是GROMACS运行一直报错,根据报错指令做了相关修改也还是不行,反而错误变得更多了,想请各位老师帮我看一下分别是哪里出了问题。目前最新的报错是:
Fatal error:
Syntax error - File run.top, line 3
Last line read:
'[ atomtypes ]'
Invalid order for directive atomtypes
For more information and tips for troubleshooting

BTFE.itp

10.16 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

DFOB.itp

6.15 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

DMS.itp

6.79 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

em.mdp

3.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

FSI.itp

5.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

Li.itp

228 Bytes, 下载次数 Times of downloads: 3

run.gro

204.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 2

run.top

1.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

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发表于 Post on 2025-10-18 22:03:27 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 student0618 于 2025-10-18 22:04 编辑

老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 45783&fromuid=64740
(出处: 计算化学公社)


这个Error搜一搜就有哦,也在推荐主题了。
敬仰一针见血的指责,厌倦别有用心的赞美。

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发表于 Post on 2025-10-19 16:26:55 | 只看该作者 Only view this author
这几个itp文件中的atomstype一栏要剪切走,放到第一个itp文件中,重复的原子定义要删掉,[atomstype]这个标题只留一个

202510191624476912..png (14.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202510191624476912..png

202510191625467745..png (77.63 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202510191625467745..png

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-20 09:08:09 | 只看该作者 Only view this author
student0618 发表于 2025-10-18 22:03
老生常谈的grompp提示Invalid order for directive atomtypes报错答疑专帖
http://bbs.keinsci.com/forum. ...

好的谢谢老师

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