可以在 Chem3D 中运行 xTB 的插件

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2025-1-4 20:23:41

本帖最后由 liyuanhe211 于 2025-1-4 23:01 编辑

冒个泡。

最近为了教学目的（针对不懂计算化学的有机化学专业学生）写了一个小玩具，通过劫持 Chem3D 的 MOPAC 菜单实现了在 Chem3D 中直接调用 xTB 优化结构、并用 MultiWFN 处理 xTB 的 molden 输出显示半经验级别的分子轨道。

主要目的是纠正不懂计算化学的学生总是错误使用 / 错误解读 Chem3D 中 MM2 优化结果的问题，对连命令行都不知道怎么打开的学生有一定科普作用。如果觉得有用可以拿去用：

Github Repo: https://github.com/liyuanhe211/xTB_in_Chem3D
粗糙的 Youtube 视频介绍：https://www.youtube.com/watch?v=yJqBK2eKTwA

国内平台要手机号不方便发，如有需要、欢迎搬运（标明出处并及时更新即可）。

wal · 发表于 Post on 2025-1-4 21:42:00

本帖最后由 wal 于 2025-1-4 21:51 编辑

这个帅

(不过之前试过看xtb计算的轨道，一个大共轭体系把σ轨道给算成HOMO，仅供娱乐了)

hydrogen2333 · 发表于 Post on 2025-8-7 21:00:14

请问一下李老师这个插件和https://github.com/grimme-lab/xtb/是一样的吗

ywj374124193 · 发表于 Post on 2025-10-17 16:55:12

李老师好，我进不去链接，显示无法打开网页，如果老师方便的话，可以把我一份插件，邮件是ywj374124193@163.com，万分感谢

wxyhgk · 发表于 Post on 2025-10-20 09:47:50

对于含有同位素的化学分子似乎有问题，没有进行特殊处理

这里的 CD3 变成了 CH3,并且和右边的螺环成键了

wal · 发表于 Post on 2025-10-20 17:53:04

wxyhgk 发表于 2025-10-20 09:47
对于含有同位素的化学分子似乎有问题，没有进行特殊处理

我看着像是D直接没了

wxyhgk · 发表于 Post on 2025-10-21 13:38:35

wal 发表于 2025-10-20 17:53
我看着像是D直接没了

感觉是

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