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[建模与可视化] 【Qbics-MolStar教程5】从图片直接导入分子

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本帖最后由 coolrainbow 于 2025-10-23 08:23 编辑

大家好,我在这里想推广一下我们开发的分子可视化与建模软件Qbics-MolStar,欢迎大家安装使用!


Qbics-MolStar基于开源程序Mol*开发,但是我们在上面做了海量的二次开发工作,使它几乎支持所有的化学对象可视化(分子、轨迹、波函数甚至正在开发的粗粒化模型)。作者作为长期一线的计算化学研究人员,在开发过程中提供的功能兼容计算化学以往的大部分经验(如VMD选择语法、Pymol选择语法、GaussView建模界面等、Multiwfn选项等),从而大大降低学习门槛。


程序提供网页版和Windows桌面版,前者用浏览器打开即用(手机都可以),后者绿色安装,可以在线升级。软件在不断开发中,欢迎大家提出宝贵意见。我们将根据用户的建议随时改进!


立即使用:https://molstar.szbl.ac.cn/viewer/


部分效果请参见:https://zhjun-sci.com/qmolstar-gallery.html


Qbics-MolStar教程(不断更新中):Qbics-MolStar教程 — Qbics-MolStar 1.0 documentation


也请大家关注下我们开发的量子化学程序Qbics:  http://zhjun-sci.com/qbics


本期为大家介绍一下利用人工智能模型,从图片直接识别分子的功能。


利用人工智能模型,Qbics-MolStar可以直接从图片识别出分子,转化为SMILES代码,并计算坐标。

假设你用手机拍摄了这么一张图片:


这张图片中包含一个分子。我们现在想把它在Qbics-MolStar中可视化出来。这张图片有很多其他元素,让我们把无用元素减裁掉,只保留分子。


现在开始识别。注意:图片分子识别功能不能在本地使用,只能在线使用。请打开:https://molstar.szbl.ac.cn/viewer 网站,然后把图片拖入浏览器内:


稍等几秒,分子就被成功识别出来,对比如下:


之后,可以在“磁盘”面板中用 Export Models 下载结构。


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发表于 Post on 2025-10-22 16:09:20 | 只看该作者 Only view this author
不知道是不是因为图片太大了,一直在转圈刷新不出来

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-23 08:24:04 | 只看该作者 Only view this author
风起~ 发表于 2025-10-22 16:09
不知道是不是因为图片太大了,一直在转圈刷新不出来

请问什么样的分子?我看一下为什么识别不出来?

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发表于 Post on 2025-10-23 10:23:40 | 只看该作者 Only view this author
coolrainbow 发表于 2025-10-23 08:24
请问什么样的分子?我看一下为什么识别不出来?

是昨天的当前网页一直在转圈
今天已经可以正常显示了

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发表于 Post on 2025-10-23 19:44:57 | 只看该作者 Only view this author
有办法从剪切板粘贴上去么?比如文献里截个图,图直接就在剪切板上了,如果要保存再找到再拖拽再删掉图就挺费劲的
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-23 21:19:35 | 只看该作者 Only view this author
wal 发表于 2025-10-23 19:44
有办法从剪切板粘贴上去么?比如文献里截个图,图直接就在剪切板上了,如果要保存再找到再拖拽再删掉图就挺 ...

这个正在改进。浏览器读取剪贴板有一定权限的问题,特别是https链接。这个正在处理

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发表于 Post on 2025-10-23 22:20:58 | 只看该作者 Only view this author
coolrainbow 发表于 2025-10-23 21:19
这个正在改进。浏览器读取剪贴板有一定权限的问题,特别是https链接。这个正在处理

可以弄个区域让用户主动粘贴 不一定要读剪切板 这样好做一些
现在的浏览器都管得太宽 直接读剪切板九成九被拦掉 关闭该保护的设置还藏在非常深的犄角旮旯里
某不知名实验组从苞米地里长出来的计算选手

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发表于 Post on 2025-10-28 14:43:16 | 只看该作者 Only view this author
对于特别大的长链分子可能不太好

屏幕截图 2025-10-28 144123.png (103.72 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

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