Gaussian是否能做显式溶剂的光谱计算？

ra2ghgzh · 发表于 Post on 2017-4-25 10:57:56

高斯既能用admp获得分子轨迹又能算光谱，那么两者能否结合计算显式溶剂的光谱？

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-25 11:01:17

可以做，但具体看做什么的，只要是溶剂分子的对溶质分子的谱没有干扰、能分离的就可以。

ra2ghgzh · 发表于 Post on 2017-4-25 11:47:30

本帖最后由 ra2ghgzh 于 2017-4-25 12:23 编辑

sobereva 发表于 2017-4-25 11:01
可以做，但具体看做什么的，只要是溶剂分子的对溶质分子的谱没有干扰、能分离的就可以。

多谢，我想算溶剂的拉曼光谱，实验中得到的结果满足无干扰、能分离的条件。
是否有相关的教程可供学习借鉴？比如您办的培训班里会讲么？。

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-25 12:57:37

ra2ghgzh 发表于 2017-4-25 11:47
多谢，我想算溶剂的拉曼光谱，实验中得到的结果满足无干扰、能分离的条件。
是否有相关的教程可供学习借 ...

拉曼光谱一般在隐式溶剂模型下做就可以
初级班和基础班都会讲

ra2ghgzh · 发表于 Post on 2017-4-25 18:28:22

本帖最后由 ra2ghgzh 于 2017-4-25 18:35 编辑

可是我想算不同浓度时的光谱，隐式模型应该算不了。
所以，请务必传授我显式溶剂的光谱算法

ra2ghgzh · 发表于 Post on 2017-4-25 21:10:53

用高斯+DFT的话内存不够
MM等方法还不跟PBC兼容

用VASP算个水分子，竟然H和O会自动分离

看来我还是老老实实学Gromacs吧

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-26 05:59:07

ra2ghgzh 发表于 2017-4-25 21:10
用高斯+DFT的话内存不够
MM等方法还不跟PBC兼容

要考虑浓度的话，AIMD能搞的大小肯定没戏
只能靠专门的MD程序跑MM动力学，然后在通过偶极自相关函数来转化成谱。动力学高级班预计会讲，VMD里也有个插件可以做，你可以先鼓捣鼓捣

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