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[CP2K] 优化金属Mg块体和表面结构奇怪,怎样解决

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想要用CP2K计算金属Mg对一个有机物的吸附能,但在优化金属镁晶胞时就出现了问题。构建了晶胞大小为16.0*16.7*22.8的板块模型,含有4层共120个原子,固定最底层优化,初始结构用MS构建,如图1所示,但优化后除了固定的那层,上面三层都显著偏离原来的位置,显得十分散乱,正常的表面弛豫不应该这么散乱才对?优化后结构如图2所示。此外我还优化了含有198个Mg原子的块体金属镁,优化后原子也十分散乱,显得很不正常,初始结构和优化后结构见图3,4,请大家帮我看一下是什么原因,是否是我计算精度太低还是哪里设置不合理。
CP2K的输入文件用Multiwfn构建,PBE泛函+D3(BJ),基组DZVP-MOLOPT-SR-GTH,对角化方法计算SCF,使用SMEAR,输入文件已上传。

202211292024469421..png (31.06 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

图1

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202211292025058822..png (49.75 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

图2

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图3

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图4

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Mg_sur.inp

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Mg_bulk.inp

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发表于 Post on 2022-11-30 10:18:06 | 只看该作者 Only view this author
考虑k点。当前大小晶胞,对于金属只考虑gamma点根本不够
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-30 15:21:05 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 h840473807 于 2022-11-30 15:22 编辑

好的,谢谢老师,做了几个测试。
1、用该等级(Gamma)对Mg同周期或同族的Be, Ca, Na, Al晶胞测试,发现都很正常,优化后结构见图1

2、用相同基组泛函,分别用MONKHORST-PACK  2 2 2和MONKHORST-PACK  3 3 3优化,结构仍然散乱,优化100步后结构如图2。

我再提升基组试一试?

202211301515094133..png (109.99 KB, 下载次数 Times of downloads: 9)

图1

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-11-30 20:07:39 | 只看该作者 Only view this author
测试了一下mDZVP, TZVP和6-31G*的结果,将CUTOFF提高到800,体相模型设置K点为2,2,2 表面模型设置K点为2,2,1,结果如图所示,对于6-31G*,体相和表面模型都能很快优化收敛,结构也合理,TZVP的体相模型能收敛,表面模型出现原子散乱。mDZVP体相与表面模型都出现原子散乱。

202211302002124577..png (172.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)

优化后结构图

优化后结构图

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-28 15:57:08 | 只看该作者 Only view this author
解决了,应该增大CUTOFF。对于金属镁,原来的CUTOFF=800不够,增加到CUTOFF=2000(CUTOFF=1300仍不够);REL_CUTOFF=80后,m-DZVP也能正常优化Mg表面结构了。

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发表于 Post on 2023-3-28 17:28:14 | 只看该作者 Only view this author
h840473807 发表于 2023-3-28 15:57
解决了,应该增大CUTOFF。对于金属镁,原来的CUTOFF=800不够,增加到CUTOFF=2000(CUTOFF=1300仍不够);RE ...

这个问题居然过了三个月才解决,是个大麻烦

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-28 18:18:24 | 只看该作者 Only view this author
七尺贱 发表于 2023-3-28 17:28
这个问题居然过了三个月才解决,是个大麻烦

因为当时用6-31G*基组了,绕开了这一问题,最近又捡起来才发现是CUTOFF的问题

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2023-3-28 20:20:57 | 只看该作者 Only view this author
感谢sob老师的CP2K培训班,让我终于解决了这个问题

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发表于 Post on 2025-12-18 20:08:38 | 只看该作者 Only view this author
我今天优化金属Mg时也出现和楼主一样的问题,想问问楼主这个cutoff=2000和REL_cutoff=80是怎么确定的,这个取值确实太大了

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发表于 Post on 2025-12-19 12:27:54 | 只看该作者 Only view this author
lisasever 发表于 2025-12-18 20:08
我今天优化金属Mg时也出现和楼主一样的问题,想问问楼主这个cutoff=2000和REL_cutoff=80是怎么确定的,这个 ...

根据官网上的一个建议“This is for the impatient CP2K user: As a rule of thumb one can multiply the largest exponent of the Gaussian basis sets employed by 40 to obtain a reasonable guess for the cutoff value in Rydberg. The first column of the CP2K basis set format contains the Gaussian exponents, e.g. for the oxygen DZVP-MOLOPT-SR-GTH basis set you may find a value of about 10.4 and the corresponding hydrogen DZVP-MOLOPT-SR-GTH basis set employs a largest exponent of about 10.0. Thus a cutoff value of 10*40 = 400 Rydberg would be a reasonable guess for a cutoff value to start with. ”https://www.cp2k.org/faq:cutoff。Mg DZVP-MOLOPT-SR-GTH DZVP-MOLOPT-SR-GTH-q10的相应数字是30.653047963189,因此至少1200+。进一步的就是自己做截断能测试,相关步骤论坛里一搜就有

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