求助：体系建模时如何根据浓度确定分子数

oillio · 发表于 Post on 2025-12-26 10:46:53

本帖最后由 oillio 于 2025-12-26 10:56 编辑

对液相体系的分子模拟进行建模，要求有机物A在有机物B中的浓度为80mg/ml，我要放入特定数量的A，但不知该如何确定有机物B的数量。
我能想到的方法一种是已知有机物A和有机物B的分子量以及有机物B的密度进行计算，得到应放入的B的数量。还有一种是根据模拟盒子的尺寸来确定。但我的体系涉及变压，所以盒子尺寸势必会变化。
求助各位老师我应该如何做？谢谢老师们的指点。

牧生 · 发表于 Post on 2025-12-26 11:31:32

本帖最后由牧生于 2025-12-26 11:34 编辑

先算好实际情况下，一定大小的盒子内应该有多少个A和B，然后建立一个稍大的盒子，放入算好数量的A和B，然后NPT跑一下就行了。

但是由于在模拟过程中，盒子尺寸是很有限的，计划80 mg/mL，实际上得到的浓度是有点偏差的，这一点点偏差是没问题的。

oillio · 发表于 Post on 2025-12-27 15:33:51

牧生发表于 2025-12-26 11:31
先算好实际情况下，一定大小的盒子内应该有多少个A和B，然后建立一个稍大的盒子，放入算好数量的A和B，然后 ...

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