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[Dalton] dalton计算求助

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本帖最后由 wyf 于 2016-9-27 14:48 编辑

       各位大神好!              如题,由于最近在做TADF分子的相关研究,学习了道尔顿的使用,想用它来计算S1态与T1态之间的自旋轨道耦合常数,但是有几个分子的计算总是报错,我也搜过一些解决方案并重复过计算(例如:删掉缓存文件),但是没能够解决我目前遇到的问题。
       还有一个问题是,dalton一般用于计算什么类型的分子呢?我再google上搜过,似乎并没有用dalton来计算TADF分子的相关文献,是否为dalton程序不能够计算TADF分子呢?
       还望诸位大神不吝赐教,万分感谢!
       附件里面为其中一个出错分子的mol,dal文件以及out文件。

error.rar

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发表于 Post on 2016-9-27 15:34:27 | 只看该作者 Only view this author
dalton应该能够计算这个旋轨耦合。我记得网上有可行的例子。然后我看了这个.dal和.mol文件,按说没有问题的。我隐约记得网上说的是,修改了dalton源程序。
然后你把这一行添加到你的文件脚本中:
dalton -mb 3000 -N $NPROCS -t /tmp/$PBS_JOBID 1.dal 1.mol你试试,不一定可行哈。
PS:我见过ADF也计算了旋轨耦合,同时我咨询一下,你计算这个soc的时候,基于谁的构型?S0.S1.还是T1?谢谢

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发表于 Post on 2016-9-27 15:38:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 小范范1989 于 2016-9-27 15:39 编辑

同时,借助您的帖子,我咨询一个问题,希望高手指点一下。
就是.dal文件中:
.PROPRT
X1MNF-SO
.PROPRT
Y1MNF-SO
.PROPRT
Z1MNF-SO

计算之后,我们得到的有
@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label,    symmetry, spin:      X1MNF-SO    1    1
@ B excited state no., symmetry, spin:             1    1    0
@ C excited state no., symmetry, spin:             2    1    1

@ B and C excitation energies, moment:   0.09025588   0.08802946   0.00000007


@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label,    symmetry, spin:      Y1MNF-SO    1    1
@ B excited state no., symmetry, spin:             1    1    0
@ C excited state no., symmetry, spin:             2    1    1

@ B and C excitation energies, moment:   0.09025588   0.08802946   0.00000005


@ Transition moment <B | A - <A> | C> in a.u. for
@ A operator label,    symmetry, spin:      Z1MNF-SO    1    1
@ B excited state no., symmetry, spin:             1    1    0
@ C excited state no., symmetry, spin:             2    1    1

@ B and C excitation energies, moment:   0.09025588   0.08802946  -0.00000003
上面的数据,最后选取数值的时候:
1:三个方向,这个最后是平方加和,再开方? 把X1MNF-SO,Y1MNF-SO,Z1MNF-SO理解为三个方向?
2:还是说:平方加和,除以3.再开方? 把X1MNF-SO,Y1MNF-SO,Z1MNF-SO理解为是三重态的三个简并态?
以上两种方案,采用哪种呢?
谢谢指点。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2016-9-27 17:05:07 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wyf 于 2016-9-27 17:09 编辑
小范范1989 发表于 2016-9-27 15:34
dalton应该能够计算这个旋轨耦合。我记得网上有可行的例子。然后我看了这个.dal和.mol文件,按说没有问题的 ...

在计算SOC时,我是基于S0的结构进行计算的。在安装道尔顿的时候,我已经将源程序symtra.F中parameter中的参数均修改为原来的10倍,同时也将投递脚本中的/opt/DALTON-Source/build/dalton -mb 1000 -t /tmp中的mb修改为5000,但是并没有解决这个问题,所以才会求助于各位大神,除了内存的原因是否存在其他的原因呢?还望大神能够指点一下,谢谢。

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发表于 Post on 2016-9-27 19:25:14 | 只看该作者 Only view this author
wyf 发表于 2016-9-27 17:05
在计算SOC时,我是基于S0的结构进行计算的。在安装道尔顿的时候,我已经将源程序symtra.F中parameter中的 ...

嘿嘿,师妹,原来是你。
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发表于 Post on 2017-5-10 21:03:12 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989,
您的问题解决了吗?我也遇到同样问题,解决不了,盼望得到您的帮助,多谢

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