Gromacs 分子動力學 CPU選擇

HarrisLin

我是台灣研究生 最近打算為了跑 Gromacs 的MD模擬 打算組一台ubuntu主機使用 GTX1080Ti 加速
最近也看過不少文章    不過對於CPU的挑選上有點抓不準上來請教一下
因為我們這邊報帳要有發票和統編  所以就暫不考慮洋垃圾(伺服器退役CPU)

註:目前人民幣對新台幣為 1:4.37左右

Ryzen 1700       NTD 10700
Ryzen 1700X     NTD 13890
I7-7700k           NTD 10800
E3-1270v5        NTD 10900
E5-2620v4        NTD 13890
I7-6850k           NTD 21000      

E5和I7(2011腳位)的X99主板因為貴上許多  因為預算盡量不考慮
所以主要就糾結在到底要 i7-7700k和 Ryzen 1700/1700X上

之前在這邊看文章是說這類模擬軟體吃實體核比較多而吃超執行緒較少
這樣Ryzen八核對I7四核確實挺誘人的
過往AMD CPU因為愚蠢架構設計導致浮點運算悲劇
不過耳聞Ryzen有修正這架構問題
所以來請教使用ubuntu Gromacs MD的話Ryzen和I7選哪個?如果選Ryzen 1700/1700X/1800X挑哪個? 謝謝

sobereva

之前的AMD的U浮点性能实在不济，不过1700X的性能令人刮目相看，论性价比，最高的也就1700X了，顶intel 6核用是没问题的。

Graphite

不搞動力學，提供個參考數據。
RYZEN 7 1700壇友稱實測Gaussian 09 自帶test397 219秒，我自用機E3-1231v3耗時約340秒。
考慮到RYZEN核多，並行效率稍有下降，實際單核浮點性能雖比不過Intel，但畢竟核多，也說得過去。
如果選擇RYZEN系列，1700 1700X 1800X 主頻/睿頻 分別為3.0/3.7 3.4/3.8 3.6/4.0 。頻率提升對計算效率基本成線性關係。
此外三者幾乎完全一樣，1700功耗是65W而另外二者是95W。

Graphite

已經買了Ryzen7-1700 ，回來補充一下：
1.多項浮點測試和經驗判斷，1700大概相當於同頻時E3-1231v3的150-170%
2.性價比絕對遠高於intel的家用i7/E3，但也沒有吹的那麼厲害，主要競爭對手是6850K。
3.1700實測超頻到全核3.6GHz可以穩定用，1700X基頻高TDP高應該能到全核4.0GHz，超不超頻都是10%+性能提升，但以後優化更好的話可能1700X再多佔點優勢。
4.我1700整機不算GPU和顯示器花了4600元，換成1700X的話則是5200元，多花10%+錢換10%+性能，也沒差。再到1800X性價比就不高了。