计算kFRET能量转移速率的问题

Lmb · 发表于 Post on 2026-1-8 17:59:45

在计算FRET能量转移速率中，看到许多文献使用的是VASP。想请问使用VASP计算的优点是什么（在交流中很多人都说VASP带不动大体系），除了用VASP还可以用哪些软件计算呢？

wangnan2256 · 发表于 Post on 2026-1-8 20:26:46

vasp优点其实有很多，教程全也多，上手容易，在平面波程序里面算是最快的之一了，精度也很高，后处理程序也很完整，赝势算是最顶尖的那一类了。至于算不动大体系，个人认识平面波里面vasp算是比较能算的动的了，要是计算资源足够的话，也可以算的动上千原子。一般的计算资源三四百应该也问题不大，当然特别难算的体系除外。这个转移速率我不太了解，也不知道其他的软件能不能算这个。

sobereva · 发表于 Post on 2026-1-9 01:22:15

看文献具体用的方法，如果不是VA$P特有的，完全可以用免费的如CP2K（算不小的体系的速度还甩它一条街，通过北京科音CP2K第一性原理计算培训班http://www.keinsci.com/KFP还很容易上手）、Quantum ESPRESSO（免费的平面波程序的首选之一，功能全面、辅助工具相当多，如今有丰富的高质量赝势）代替。VA$P如今卖得很贵，真正非得使用并购买VA$P的情况并不多，之前很多文章用有很大历史惯性原因在内。

Lmb · 发表于 Post on 2026-1-9 11:23:43

感谢各位老师回复

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