本帖最后由 qiyachen 于 2026-3-12 17:38 编辑
大家好，我是一名在读研究生，目前正在尝试使用Haddock对连接酶和双链DNA分子进行对接，以模拟连接酶连接DNA末端。但是因为初次接触分子对接，还在摸索阶段，很多相关操作还不是很了解,,所以想请教一下大家。
这个对接需要用到连接酶和两个双链DNA分子，但是当我在“Input data”界面上传完这三个PDB文件，并在“input parameter“界面填写好对接活性位点后，点击NEXT却无法进入”docking parameter“界面，而是再次返回了已经填写好的“input parameter“界面，也未见系统报错，导致这个对接项目一直无法提交（各界面如图所示）。而我在进行一蛋白一核酸两分子对接时完全可以进入docking parameter并提交对接项目。
所以想请教一下大家：
- 以上这种情况是什么原因导致的？又该怎么解决呢？
- 有无Haddock对接蛋白和核酸的教程推荐？如果您会相关操作可以教一下我吗？
- 或者有其它对接蛋白和核酸的工具推荐吗？
感谢解答！
附：
在我的操作中input data界面如图：
input parameter界面如图：蛋白质和DNA分子我都只在Molecule 1处填写了Active residues部分，其它保持默认
| 
发表于 Post on 2026-3-12 17:40:52
|
只看该作者 Only view this author
|只看大图 View big picture
|倒序浏览 Reverse view
|阅读模式 Reading model
收藏 Add to favorites
楼主 Author