ligparen生成lammps软件oplsaa力场问题

XYP · 发表于 Post on 2022-8-19 18:54:37

ligparen生成lammps软件oplsaa力场问题，键长键角以及二面角信息有些重复，没有明确的标识。如：# c3 # c3-c2 # c2-c3-h # h-c3-c2-h，有什么解决的办法吗？

nater1ver · 发表于 Post on 2022-9-14 17:52:53

没有重复，人家只是把每个原子指定成一个原子类型然后做的拓扑

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[Lammps] ligparen生成lammps软件oplsaa力场问题