盐酸盐类手性有机化合物ORD计算，构象搜索的问题

timefree · 发表于 Post on 6 hour ago

各位老师：

我想使用gaussian对如下这个盐酸盐化合物进行ORD计算（实测溶剂是甲醇），那我在构象搜索时，构建的模型是A结构的游离态，还是B结构的离子态呀？

谢谢大家！

wzkchem5 · 发表于 Post on 5 hour ago

要算B，因为由有机常识可知胺类的碱性比较强，普通铵盐溶于中性的水、醇溶剂，绝大部分不电离。
此外这个盐和溶剂有强氢键，为求计算准确，建议做显式溶剂化

timefree · 发表于 Post on 5 hour ago

wzkchem5 发表于 2026-4-24 09:42
要算B，因为由有机常识可知胺类的碱性比较强，普通铵盐溶于中性的水、醇溶剂，绝大部分不电离。
此外这个 ...

谢谢老师。我试着用Spartan软件分别对A和B结构进行构象搜索，两者搜出的构象数差别很大。

另外，您说的显式溶剂化指的是什么？

wzkchem5 · 发表于 Post on 2 hour ago

timefree 发表于 2026-4-24 10:04
谢谢老师。我试着用Spartan软件分别对A和B结构进行构象搜索，两者搜出的构象数差别很大。

另外，您说 ...

在这个论坛搜“显式溶剂化”，有大量的解释和讨论

timefree · 发表于 Post on 17 min ago

wzkchem5 发表于 2026-4-24 12:48
在这个论坛搜“显式溶剂化”，有大量的解释和讨论

谢谢老师！

wal · 发表于 Post on 5 min ago

上周做了一个构象权重ECD，结构是某抗生素盐酸盐，一开始没留意直接上了，算出来发现峰形不太对，后面想起来里面一个噻唑是可以质子化的，加上这个之后再构象权重算出来光谱就正常了
要早点有这一贴就好了hhh

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[综合交流] 盐酸盐类手性有机化合物ORD计算，构象搜索的问题