磷酸LOL平面图如何绘制

aipacino · 发表于 Post on yesterday 15:13

各位老师好，我想分析磷酸分子的羟基氧和双键氧各自接收氢键的能力，以证明磷酸分子可以给三个氢键但只有双键氧可以稳定接收最多两个氢键，导致体相磷酸的氢键网络不平衡，存在不稳定性的这一观点。现在想分析电子定域性，根据http://sobereva.com/63和http://sobereva.com/610的教程绘制磷酸的1,2,7号原子平面的LOL填色图，结果是下面这样的，我不是很理解左图和右图的对应关系，并且想知道这种三维结构的分子应该怎样去画这个图合适一些？

sobereva · 发表于 Post on yesterday 23:41

我不是很理解左图和右图的对应关系

语义不明。如果你是觉得难以判断平面图和立体结构的对应关系，在Multiwfn后处理菜单要求把原子标签（元素+序号）都显示出来，就很容易对照了
要么就画等值面图而非平面图

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 1 hour ago

本帖最后由 SharkYYX2025 于 2026-5-22 00:49 编辑

如果是为了比较双键氧 OH氧的区别，区别是孤对电子？建议用ELF，孤对电子更明显
ELF综述和重要文献小合集 - 波函数分析与Multiwfn (Wavefunction Analysis & Multiwfn) - 计算化学公社 http://bbs.keinsci.com/thread-2100-1-1.html

我拿类似的分子试了下，是一个咔唑膦酸，P上面连接一个碳原子，三个氧原子。双键氧 OH氧成键和你的类似。

拿主功能5绘制三维空间的ELF。然后适当调大等值面，仔细观察O的孤对电子方向，选出原子序号，比如16,18,31用于绘图平面
拿主功能4绘制二维图。选择 4: Define by three atoms 对于Please define the plane to be plotted，你也可以选择其他方法定义平面

然后挑15 17 18再看看。但不明显

或者参考以下方法
绘制静电势全局极小点+等值面图展现孤对电子位置的方法 http://sobereva.com/493
通过电子定域化函数(ELF)、价层电子密度分析讨论亲核进攻的方向 http://sobereva.com/606 看 2 电子定域化函数的拓扑分析

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[波函数分析求助] 磷酸LOL平面图如何绘制