计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 13547|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 过渡态能垒的计算问题

[复制链接 Copy URL]

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

过渡态能垒的统计如图所示:
HF是取优化好的log文件中 HF=-3132.8950088,zero是取优化好的log文件中 Zero-point correction= 0.313813 (Hartree/Particle),
E是(HF+zero)*627.51
能垒=E过渡态 - E前期
我想知道为什么这么统计就得到能垒?原理是什么呢?谢谢!

图1.png (6.27 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

图1.png

3097

帖子

29

威望

1万

eV
积分
17221

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2017-6-13 19:08:41 | 只看该作者 Only view this author
要么用电子能(HF)、对应电子能垒,要么用自由能(HF+ZPE+H(0->T)-TS)、对应自由能垒。HF+ZPE啥都不是(←我知道很多文献里用这个量)。

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-13 20:20:53 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-6-13 19:08
要么用电子能(HF)、对应电子能垒,要么用自由能(HF+ZPE+H(0->T)-TS)、对应自由能垒。HF+ZPE啥都不是( ...

△G=前期(HF+Thermal correction to Gibbs Free Energy)-过渡态(HF+Thermal correction to Gibbs Free Energy)  自由能垒是这样统计的吗?

图3.png (15.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 45)

图3.png

586

帖子

0

威望

4192

eV
积分
4778

Level 6 (一方通行)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-6-13 20:48:55 | 只看该作者 Only view this author
Zero-point correction
Thermal correction to Energy
Thermal correction to Enthalpy
Thermal correction to Gibbs Free Energy
这四个量都代表什么意思呢?谢谢!

28

帖子

0

威望

106

eV
积分
134

Level 2 能力者

5#
发表于 Post on 2017-6-13 20:50:04 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2017-6-13 19:08
要么用电子能(HF)、对应电子能垒,要么用自由能(HF+ZPE+H(0->T)-TS)、对应自由能垒。HF+ZPE啥都不是( ...

请问老师,HF+ZPE为什么啥都不是呢, 计算发射光谱的时候0-0跃迁的能量不是两个态的HF+ZPE的能量差吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2017-6-13 20:56:06 | 只看该作者 Only view this author
清岚 发表于 2017-6-13 20:50
请问老师,HF+ZPE为什么啥都不是呢, 计算发射光谱的时候0-0跃迁的能量不是两个态的HF+ZPE的能量差吗?

这是0K下的热力学量,你研究的又不是0K的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

7#
发表于 Post on 2017-6-13 20:56:43 | 只看该作者 Only view this author
15whyhq 发表于 2017-6-13 20:48
Zero-point correction
Thermal correction to Energy
Thermal correction to Enthalpy

热力学数据计算的基本常识看
两篇热力学数据计算的入门介绍文章
http://bbs.keinsci.com/forum.php?mod=viewthread&tid=123
更详细清晰的式子看此文的文档
Shermo:计算气相分子配分函数和热力学数据的简单程序
http://sobereva.com/315
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

28

帖子

0

威望

106

eV
积分
134

Level 2 能力者

8#
发表于 Post on 2017-6-13 21:12:24 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-6-13 20:56
这是0K下的热力学量,你研究的又不是0K的

老师,如果计算0k下的能量需要加上ZPE校正吗?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125131

管理员

公社社长

9#
发表于 Post on 2017-6-13 21:12:35 | 只看该作者 Only view this author
清岚 发表于 2017-6-13 21:12
老师,如果计算0k下的能量需要加上ZPE校正吗?

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

28

帖子

0

威望

106

eV
积分
134

Level 2 能力者

10#
发表于 Post on 2017-6-13 21:17:34 | 只看该作者 Only view this author

好的,非常感谢老师!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 06:16 , Processed in 0.177942 second(s), 23 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list