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[VMD] vmd能不能把1250帧全部扫描保存成一个pdb?

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我在amber里边跑了1250帧,然后在vmd中用拓扑配上轨迹文档,我想截取一下离肽链3埃米以内的所有的蛋白质残基,因为每一帧都不一样的构象,我想把1250帧只要距离蛋白3埃都截下来保存成一个pdb文档,这样能做到吗?肽链是6个残基的

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发表于 Post on 2024-10-31 16:06:48 | 只看该作者 Only view this author
用动态选区时,VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃,没有埃米
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-10-31 19:37:33 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-10-31 16:06
用动态选区时,VMD保存时只对其中第一帧的结构判断哪些原子被写入轨迹文件

只有埃,没有埃米[/backcolor ...

谢谢sob老师

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