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[新手求助] 过渡态结构计算问题

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          老师好,我想求反应的过渡态,之前用TS方法,但求出的过渡态经过IRC之后一直连接不了反应物,于是使用QST2方法,但是求出的过渡态结构与假设的反应物和中间体相差很大,用此过渡态做的IRC也是连接不了假设的反应物和中间体,请问老师,是我QST2方法用错了,还是假设的反应物和中间体本身有问题呢?
          图片是我参考的文章中做的模拟,想做类似反应的模拟,请问我这种方法一直做的话,做的通吗?老师有推荐的方法吗?非常感谢老师的阅读

反应路径.png (76.34 KB, 下载次数 Times of downloads: 17)

我参考的文章,想做类似的模拟

我参考的文章,想做类似的模拟

文献的结构图.png (9.21 KB, 下载次数 Times of downloads: 16)

文献的结构图.png

BN ethanol qs2.gjf

3.52 KB, 下载次数 Times of downloads: 4

TS1IRC.LOG

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发表于 Post on 2018-1-14 22:25:58 | 只看该作者 Only view this author
上传较大文本文件前一定要先压缩!以节约论坛空间、降低他人下载耗时
并且帖子标题要明确,直接反映帖子内容。考虑写一篇论文的时候是怎么起文章标题的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2018-1-14 22:28:42 | 只看该作者 Only view this author
先确认过渡态虚频方向正确,再去跑IRC。虚频都明显不靠谱,跑IRC只会纯粹浪费时间
不要指望QST2比人聪明,QST2经常初猜的过渡态结构根本不靠谱,优化出来自己期望的过渡态更是不可能
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-14 22:28:47 | 只看该作者 Only view this author
非常抱歉,这是我压缩后的文件,谢谢您

模拟的问题.rar

729.23 KB, 下载次数 Times of downloads: 5

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-14 22:31:11 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-14 22:28
先确认过渡态虚频方向正确,再去跑IRC。虚频都明显不靠谱,跑IRC只会纯粹浪费时间
不要指望QST2比人聪明, ...

非常感谢老师的答复,之前老师有说过TS 方法较适合,可总是有“IRC路径与自己设想想去太远”的问题,这个是自身化学知识薄弱,基元反应假设错误的缘故吗?

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发表于 Post on 2018-1-14 22:37:55 | 只看该作者 Only view this author
Faye 发表于 2018-1-14 22:31
非常感谢老师的答复,之前老师有说过TS 方法较适合,可总是有“IRC路径与自己设想想去太远”的问题,这个 ...


opt=TS适用于一切问题,能否找到应有的过渡态,纯粹看自己给的初猜结构是否适合,以及一些关键词是否有助于收敛到过渡态。
过渡态找对了,IRC自然就能往实际的基元反应的产物和反应物方向走。
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发表于 Post on 2018-1-14 22:40:03 | 只看该作者 Only view this author
你的输入文件明显不合理
你的IRC任务的初始结构是极小点结构,和过渡态完全没有相似性,显然不可能走得通IRC
常识看
在Gaussian中计算IRC的方法和常见问题
http://sobereva.com/400

而且QST2的输入文件里的两帧也不对应于反应物和产物复合物结构,显然也找不到过渡态
这种体系不要用QST2

标题给你改了

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eV +5 收起 理由
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Faye + 5 谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-14 22:44:53 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢老师的回复,真的非常感谢您!

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