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[Multiwfn使用咨询] 相关bcp搜索不到

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向各位老师请教:1.附件中是fchk文件,拓扑分析时,最长的和最短c-cr键的bcp找到了,但并不是所有的c-cr的bcp都找到了。满足PH关系。问题是既然最长的和最短c-cr键的bcp找到了,那不应该是所有的c-cr的bcp都应该有吗?
2. b-cr的bcp怎么会没有,怎么会出现一个RCP(3.+1)?
麻烦大家帮分析一下,谢谢!
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发表于 Post on 2018-1-23 11:12:50 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新人必读贴所示,上传较大文本型文件前一定要压缩,以节约论坛非常宝贵的空间、加快他人下载速度
我给你压缩后重新上传了,尺寸只有原先的1/4
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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发表于 Post on 2018-1-23 11:21:06 | 只看该作者 Only view this author
当前体系临界点
The number of critical points of each type:
(3,-3):    29,   (3,-1):    34,   (3,+1):     6,   (3,+3):     0
Poincare-Hopf relationship verification:   29  -   34  +    6  -    0  =   1
Fine, Poincare-Hopf relationship is satisfied, all CPs may have been found

总共就是这些


并非所有看似有直接相互作用的原子间都理应有BCP,如果搞不清楚,看此文
利用约化密度梯度考察AIM临界点的位置
http://sobereva.com/267

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-23 11:35:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-23 11:12
如置顶的新人必读贴所示,上传较大文本型文件前一定要压缩,以节约论坛非常宝贵的空间、加快他人下载速度
...

看到没有超过上传大小要求限制,就上传了。考虑不周,谢谢sob指出,今后注意。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-23 11:58:09 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-23 11:21
当前体系临界点
The number of critical points of each type:
(3,-3):    29,   (3,-1):    34,   (3,+1 ...

再请问卢老师,我已经用Multiwfn计算除了最长的和最短的c-cr键的bcp对应的Laplacian of electron density大于0,the -Gb/Vb between 0.7 and 1,energy density (Hb)小于0,是不是就可以说配体与中心原子成键有部分共价键特征,而不需要再考虑配体中B原子与Cr的成键情况?配位模式呢?6配位还是7配位?谢谢!

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发表于 Post on 2018-1-23 15:27:16 | 只看该作者 Only view this author
jctyp 发表于 2018-1-23 11:58
再请问卢老师,我已经用Multiwfn计算除了最长的和最短的c-cr键的bcp对应的Laplacian of electron density ...

配位数可以用主功能100里的选项9来计算,一般还是靠谱的
当前肯定是共价作用,典型的配位键
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-23 21:02:43 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-23 15:27
配位数可以用主功能100里的选项9来计算,一般还是靠谱的
当前肯定是共价作用,典型的配位键

谢谢卢老师!

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