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[新手求助] 半经验的分子动力学模拟程序有哪些推荐的?

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如题,请教各位老师:有没有基于半经验的分子动力学程序可以推荐下,可以添加显示水模型进行模拟?谢谢大家。

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发表于 Post on 2018-3-12 11:58:16 | 只看该作者 Only view this author
Grimme的xtb程序,可以基于GFN-XTB方法做动力学
高斯也可以在半经验下做AIMD
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发表于 Post on 2018-3-12 13:23:22 | 只看该作者 Only view this author
半经验方法能看入眼的只有PM7,DFTB3和GFN-XTB

前者可以用ASE搭配MOPAC
第二个可以用DFTB+
第三个可以用SOB说的xtb程序

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-3-13 15:54:22 | 只看该作者 Only view this author
fhh2626 发表于 2018-3-12 13:23
半经验方法能看入眼的只有PM7,DFTB3和GFN-XTB

前者可以用ASE搭配MOPAC

谢谢老师,后两个我看了下应该可以,但是您说的第一个ASE+MOPAC我看ASE的官网介绍似乎没有提及有MOPAC的接口,老师您是怎么做的?能够描述下么?谢谢啦

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发表于 Post on 2018-3-14 09:19:51 | 只看该作者 Only view this author
harrypotty18 发表于 2018-3-13 15:54
谢谢老师,后两个我看了下应该可以,但是您说的第一个ASE+MOPAC我看ASE的官网介绍似乎没有提及有MOPAC的 ...

官网上有的吧

https://wiki.fysik.dtu.dk/ase/dev/ase/calculators/mopac.html

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发表于 Post on 2018-3-23 23:55:38 | 只看该作者 Only view this author
Amber就能用半经验做动力学,但不知可靠性如何,是否值得推荐

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