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[GROMACS] mcpb.py生成的拓扑文件转为gromacs格式后有三个settles该怎么处理

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YuniJ

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楼主
发表于 Post on 2024-3-13 23:43:17 | 只看该作者 Only view this author |只看大图 View big picture 回帖奖励 |倒序浏览 Reverse view |阅读模式 Reading model
使用mcpb.py生成蛋白酶与底物复合物的拓扑文件后，将其转为gromacs接受的格式发现top文件中有三个settles字段：配位水分子WT1、配位水分子WT2、溶剂水分子,请问各位大佬该如何处理配位水分子的settles字段呢？

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