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[波函数分析求助] 请问图中的电荷转移和方向是怎么计算的?

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本帖最后由 zhangxinxin 于 2025-4-8 17:37 编辑

请问图中的电荷转移和方向是怎么计算的?

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发表于 Post on 2025-4-7 17:54:17 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Stardust0831 于 2025-4-7 17:58 编辑

算出原子电荷,把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可以参考《一篇深入浅出、完整全面介绍原子电荷的综述文章已发表!》,我个人一般会用Mulliken电荷。
计算流程可以参考:《使用Multiwfn计算分子的某个片段的电荷》,选出片段对应的序号、使用multiwfn读取复合物对应的波函数文件,然后使用multiwfn分析就可以。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 17:59:20 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 17:54
算出原子电荷,把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可 ...

谢谢1、MULLIKEN电荷出来的结果不是已经是净电荷的结果了吗?还需要自己加减原子电荷?
2、mulliken电荷需要先结构优化到6-311再单点能优化吗?

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发表于 Post on 2025-4-7 18:03:06 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-4-7 17:59
谢谢1、MULLIKEN电荷出来的结果不是已经是净电荷的结果了吗?还需要自己加减原子电荷?
2、mulliken电荷 ...

1.需要把每个片段所有原子对应的MULLIKEN电荷加起来,就是这个片段带的电荷数(也就是被转移走/获得的电子数)
2.没有叫“6-311”的东西。计算原子电荷前需要结构优化。可以换个更好的基组再算个单点,结构优化基组够大的话,也可以直接用结构优化最后一步对应的波函数文件。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 20:00:06 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 18:03
1.需要把每个片段所有原子对应的MULLIKEN电荷加起来,就是这个片段带的电荷数(也就是被转移走/获得的电 ...

好的谢谢纠正 1、您说还需要把原子对应电荷加起来?之前不是已经选中了对应片段吗?图片上计算出来的不就是已经加和的结果了吗?还需要自己再加一次?

202504071957531036..png (105.14 KB, 下载次数 Times of downloads: 26)

202504071957531036..png

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发表于 Post on 2025-4-7 20:20:44 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-4-7 20:00
好的谢谢纠正 1、您说还需要把原子对应电荷加起来?之前不是已经选中了对应片段吗?图片上计算出来的不就 ...

你拿到的数据就是加好了的,加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 21:13:27 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 20:20
你拿到的数据就是加好了的,加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

但算出来的结果和别人的文献的相差有点大,是因为什么呢?选的分子片段是一样的

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 21:20:51 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 20:20
你拿到的数据就是加好了的,加起来这步软件帮你完成了。
直接用加和的结果。

就是和我想要的结果不太一样,该转的多的并不多,理想中转移的少的反而转的电荷多

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发表于 Post on 2025-4-7 21:58:08 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-4-7 21:13
但算出来的结果和别人的文献的相差有点大,是因为什么呢?选的分子片段是一样的

构象和计算级别是否一致?是否选用了同一种原子电荷?
《谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因》


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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 22:08:13 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 21:58
构象和计算级别是否一致?是否选用了同一种原子电荷?
《谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因 ...

同一种原子电荷是指自己所选片段和别人选的片段一致的意思?片段是一致的。
构象能看出来别人的?

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发表于 Post on 2025-4-7 22:21:17 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-4-7 22:08
同一种原子电荷是指自己所选片段和别人选的片段一致的意思?片段是一致的。
构象能看出来别人的?

问题一:确保文献里算的原子电荷也是Mulliken电荷,而不是其他类型的原子电荷。原子电荷的定义要一致。
问题二:确保和文献里用的是同一种构象。必要时可以考虑做构象搜索《使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 22:32:52 | 只看该作者 Only view this author
好的谢谢您!非常感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-7 22:33:26 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 22:21
问题一:确保文献里算的原子电荷也是Mulliken电荷,而不是其他类型的原子电荷。原子电荷的定义要一致。
...


好的谢谢您!非常感谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-4-8 11:50:46 | 只看该作者 Only view this author
Stardust0831 发表于 2025-4-7 17:54
算出原子电荷,把每个片段的原子电荷加起来就得到这个片段在结合后得到/失去的电子数。
原子电荷的选择可 ...

您分享的这个计算电荷的视频例子用的是ADCH电荷分布,mulliken电荷分布也能用multiwfn分析吗

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发表于 Post on 2025-4-8 12:01:55 | 只看该作者 Only view this author
zhangxinxin 发表于 2025-4-8 11:50
您分享的这个计算电荷的视频例子用的是ADCH电荷分布,mulliken电荷分布也能用multiwfn分析吗

可以

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