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[新手求助] 求助B3LYP*泛函中色散校正的输入方法

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本帖最后由 Shejon 于 2022-6-30 16:34 编辑

各位老师好,我在尝试优化一个Fe3+与没食子酸的单核配合物构型,查到相关文献有用B3LYP*泛函(HF15%的泛函),但是发现em=gd3会导致R6DS8: Unable to choose the S8 parameter错误,查阅论坛以后发现是使用 em=gd3时程序未存有相应泛函的D3色散校正参数导致的。
在Gaussian官网查阅发现G16里面是有相关参数定义的,原文:The table below gives the list of functionals in Gaussian 16 for which GD3 parameters are defined. For these functionals, dispersion is requested with EmpiricalDispersion=GD3同时查到 IOps(3/174-176) 可以加入色散校正,但是本人不知道如何输入了,在此请了解的老师告诉我一下应该如何在这个任务中加入色散校正,谢谢。纯新手,第一次发帖多有冒犯还请各位多多指点,谢谢了。


使用版本Gaussian16 Revision C.01
任务信息
# opt genecp blyp iop(3/76=1000001500,3/77=0720008500,3/78=0810010000)


-1 6
O                 -1.58300000   -0.26300000   -0.75500000
O                 -6.51700000   -0.98200000   -3.98700000
C                 -4.31400000   -0.52900000   -3.01300000
C                 -5.71900000   -0.54700000   -2.99100000
O                  0.58300000   -1.51400000    0.66500000
O                  2.42700000   -6.14600000    3.89600000
C                  1.71800000   -4.01100000    2.92200000
C                  2.40500000   -5.23800000    2.90000000
O                  7.08100000   -0.26300000   -0.75500000
O                  2.14700000   -0.98200000   -3.98700000
C                  4.35000000   -0.52900000   -3.01300000
C                  2.94500000   -0.54700000   -2.99100000
O                  0.87000000   -1.34800000    2.86500000
O                  3.96000000   -5.26100000   -0.36700000
O                  3.79800000   -6.75000000    1.76500000
C                  1.01500000   -1.93000000    1.76500000
C                  1.76700000   -3.23200000    1.76500000
C                  2.46600000   -3.58000000    0.60700000
C                  3.18400000   -4.78800000    0.63000000
C                  3.12100000   -5.57800000    1.76500000
O                 -7.72600000   -0.09700000   -1.85600000
C                 -2.15900000   -0.09700000   -1.85600000
C                 -3.66300000   -0.09700000   -1.85600000
C                 -6.37200000   -0.09700000   -1.85600000
O                 -1.58300000    0.06800000   -2.95600000
C                 -4.31400000    0.33400000   -0.69800000
C                 -5.71900000    0.35200000   -0.72000000
O                 -6.51700000    0.78700000    0.27600000
O                 -3.74900000    5.99000000    0.66500000
O                 -1.90500000    1.35700000    3.89600000
C                 -2.61400000    3.49200000    2.92200000
C                 -1.92700000    2.26500000    2.90000000
O                  0.93800000   -0.09700000   -1.85600000
C                  6.50500000   -0.09700000   -1.85600000
C                  5.00100000   -0.09700000   -1.85600000
C                  2.29200000   -0.09700000   -1.85600000
O                  7.08100000    0.06800000   -2.95600000
Fe                 0.19900000    0.32300000   -0.04500000
C                  4.35000000    0.33400000   -0.69800000
C                  2.94500000    0.35200000   -0.72000000
O                  2.14700000    0.78700000    0.27600000
O                 -3.46200000    6.15500000    2.86500000
O                 -0.37200000    2.24200000   -0.36700000
O                 -0.53400000    0.75300000    1.76500000
C                 -3.31700000    5.57400000    1.76500000
C                 -2.56500000    4.27100000    1.76500000
C                 -1.86600000    3.92300000    0.60700000
C                 -1.14800000    2.71500000    0.63000000
C                 -1.21100000    1.92500000    1.76500000
H                  2.48800000   -2.95500000   -0.27300000
H                  1.15900000   -3.70300000    3.79900000
H                 -1.85700000    4.55100000   -0.28400000
H                 -3.17500000    3.79200000    3.80600000
H                 -3.77900000    0.66200000    0.18100000
H                 -3.78100000   -0.86400000   -3.89700000
H                  4.89000000   -0.86700000   -3.89600000
H                  4.89000000    0.65500000    0.19300000
H                  3.65000000   -7.22000000    2.60600000
H                  1.88400000   -5.86900000    4.65500000
H                  3.67400000   -4.95200000   -1.23800000
H                 -6.04200000    0.88200000    1.11600000
H                 -8.06200000    0.22700000   -1.00000000
H                 -7.45600000   -0.91800000   -3.73000000
H                 -3.96500000    6.96600000    2.62000000
H                  8.03500000    0.02700000   -2.71200000
H                 -2.43000000    1.60600000    4.68500000
H                  2.62500000   -1.32700000   -4.77000000
H                 -0.22319757    2.66727165   -1.21470388
H                  2.68717434    1.10463281    1.00326961

C O H 0
6-31+G**
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Fe 0
LANL2DZ
****

Fe 0
Lanl2dz

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发表于 Post on 2022-6-30 16:38:46 | 只看该作者 Only view this author
首先得查到B3LYP*的色散校正参数,只有从文献查到这个泛函的色散校正参数,才能谈怎么从输入文件输入的问题。如果查不到,建议改成其他类似泛函,比如TPSSh等
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2022-6-30 20:06:43 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP*这种非主流泛函基本不可能有人给其专门搞D3参数。优化这个体系也没必要带D3,显然色散作用不会明显影响体系构型。
优化这种体系也没必要用这个,TPSSh、PBE0通常都是更好选择
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 08:52:22 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2022-6-30 16:38
首先得查到B3LYP*的色散校正参数,只有从文献查到这个泛函的色散校正参数,才能谈怎么从输入文件输入的问题 ...

感谢回答,明白了,我换一个泛函吧。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-7-1 08:52:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-6-30 20:06
B3LYP*这种非主流泛函基本不可能有人给其专门搞D3参数。优化这个体系也没必要带D3,显然色散作用不会明显影 ...

谢谢sob老师,我换个泛函。

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