使用molclus程序结合高斯程序做分子构象搜索，不知道怎样启动高斯文件

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-2 23:49:01

本帖最后由风飞于 2018-7-2 23:57 编辑

老师：您好！我在做过渡态的计算，现在在算两种反应物的构型，想结合molclus程序进行计算，我的分子小，原子个数有7个，根据您的帖子，我已经设置了高斯的环境变量：
然后我在高斯VieW中构建了反应物的团簇分子，并且放在了molclus程序位置，并且命名为template，我也修改了setting中相关参数，如图，可是还是出错，打开molclus程序提示如下：
请问是怎么回事呢？他说找不到traj.xyz 怎样设置呢？谢谢老师！

sobereva · 发表于 Post on 2018-7-3 00:35:24

提示得很明确，相关帖子里也写得很明确，你得首先产生记录了初始构型的traj.xyz文件（用动力学程序或者molclus自带的genmer、gentor），放在当前目录下，molclus才能运行

仔细阅读此文，了解molclus的思想和运行流程
使用molclus程序做团簇构型搜索和分子构象搜索
http://bbs.keinsci.com/thread-577-1-1.html

你当前机子里装的G09，你总得把settings.ini里的gaussian_path改成相应路径才行
你的GAUSS_EXEDIR环境变量设的也完全不对，要一个字一个字仔细阅读molclus帖子里的说明

风飞 · 发表于 Post on 2018-7-4 23:26:23

sobereva 发表于 2018-7-3 00:35
提示得很明确，相关帖子里也写得很明确，你得首先产生记录了初始构型的traj.xyz文件（用动力学程序或者molc ...

老师，学会了，，谢谢您

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