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[GROMACS] 求助:锂层中锂的力场参数

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各位老师好:如下图,我使用packmol构建了锂金属负极和电解液体系,准备用Gromacs进行MD模拟。请问下面的锂层应该使用什么力场啊?

202205141929371278..png (425.98 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

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发表于 Post on 2022-5-14 20:03:38 | 只看该作者 Only view this author
http://sobereva.com/153
看一下这个可能有帮助

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发表于 Post on 2022-5-14 20:53:16 | 只看该作者 Only view this author

楼主想要的应该是金属锂的参数。似乎文献中还没有报道过单质金属锂的参数
又菜又爱玩

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发表于 Post on 2022-5-14 21:19:09 | 只看该作者 Only view this author
金属单质好多都没有现成参数,恐怕得自己想办法拟合。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-14 21:36:47 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-5-14 20:53
楼主想要的应该是金属锂的参数。似乎文献中还没有报道过单质金属锂的参数

是的,找了很多都是锂离子的参数

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-14 21:36:59 | 只看该作者 Only view this author
妙角不脆 发表于 2022-5-14 21:19
金属单质好多都没有现成参数,恐怕得自己想办法拟合。

好吧,感谢回复

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-14 21:37:58 | 只看该作者 Only view this author
心向暖阳 发表于 2022-5-14 20:03
http://sobereva.com/153
看一下这个可能有帮助

好的吗,我去看看

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发表于 Post on 2022-5-14 23:52:14 | 只看该作者 Only view this author
xjw 发表于 2022-5-14 21:36
是的,找了很多都是锂离子的参数

明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab,第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochimica Acta 234 (2017) 43–51,里面直接给了Li的LJ参数
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-15 10:37:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-14 23:52
明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab,第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochi ...

谢谢老师,我去看看

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-15 11:36:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-14 23:52
明显是你找的方式不对
Google学术里搜GROMACS Li slab,第一篇就是用GROMACS模拟含Li板的文章Electrochi ...

老师您好,我在那篇文章中找到了Li的参数。但是看这篇文章的时候有一个新问题。我看在下图中的这句。文中除了锂层的参数外,PEO用到了OPLS-AA的力场参数,但是锂离子用的是GAFF力场参数。我在论坛中找到,GAFF力场和Amber力场是可以兼用的。但是OPLS-AA和GAFF也可以兼用嘛?为什么一个体系可以同时使用这两种力场啊?

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发表于 Post on 2022-5-15 21:44:09 | 只看该作者 Only view this author
xjw 发表于 2022-5-15 11:36
老师您好,我在那篇文章中找到了Li的参数。但是看这篇文章的时候有一个新问题。我看在下图中的这句。文中 ...

没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-16 11:19:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-15 21:44
没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了

嗯嗯,那请问老师。那个文章中Li金属的参数可以直接和GAFF力场一起用嘛?需要做一定的转换嘛?

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发表于 Post on 2022-5-17 02:12:57 | 只看该作者 Only view this author
xjw 发表于 2022-5-16 11:19
嗯嗯,那请问老师。那个文章中Li金属的参数可以直接和GAFF力场一起用嘛?需要做一定的转换嘛?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-5-17 13:34:15 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢老师

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发表于 Post on 2023-3-28 09:25:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2022-5-15 21:44
没任何必要效仿
Li以外的部分都用GAFF就完了

请问老师,这个Li金属的势参数与 电解液原子(OPLS-AA)的vdW势参数之间的组合规则怎么确定呢?sigma是用几何平均吗

本版积分规则 Credits rule

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