计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 26934|回复 Reply: 9
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 能垒图分析

[复制链接 Copy URL]

286

帖子

0

威望

1134

eV
积分
1420

Level 4 (黑子)

本帖最后由 lei234 于 2015-5-1 10:31 编辑

请问如何分析图中的两条反应路径?三个值从左到右分别是反应物、过渡态、产物

QQ图片20150501102512.png (3.4 KB, 下载次数 Times of downloads: 481)

1

1

QQ图片20150501102538.png (4.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 445)

2

2

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2015-5-3 09:30:42 | 只看该作者 Only view this author
没什么好分析的,从图上只不过能看出正、逆反应能垒,以及反应能而已。
第二张图明显不对。中间显然不是过渡态。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

9

帖子

0

威望

104

eV
积分
113

Level 2 能力者

3#
发表于 Post on 2015-5-5 11:19:56 | 只看该作者 Only view this author
这是什么反应 这个不是过渡态吧

286

帖子

0

威望

1134

eV
积分
1420

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-6 09:01:00 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-3 09:30
没什么好分析的,从图上只不过能看出正、逆反应能垒,以及反应能而已。
第二张图明显不对。中间显然不是过 ...

中间是固定了以后得到的过渡态,不固定始终找不到过渡态,过渡态的能量一定要比反应物低吗?有没有这种反应物、过渡态和产物的能量一直在降低,或者反应物、过渡态和产物的能量一直在上升的?

286

帖子

0

威望

1134

eV
积分
1420

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-5-6 09:02:21 | 只看该作者 Only view this author
yyccumt 发表于 2015-5-5 11:19
这是什么反应 这个不是过渡态吧

是过渡态结构,但是固定优化后得到的,所以有两个虚频,第二个在100左右,第一个1000多

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2015-5-6 09:43:59 | 只看该作者 Only view this author
你对过渡态的本质理解不对。对于基元反应,过渡态能量一定比反应物和产物都高。
固定优化得到的不叫过渡态,即便找出来也是虚假的过渡态。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

127

帖子

1

威望

1231

eV
积分
1378

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2015-5-6 23:39:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-6 09:43
你对过渡态的本质理解不对。对于基元反应,过渡态能量一定比反应物和产物都高。
固定优化得到的不叫过渡态 ...

Sob老师,过渡态能量似乎可以比反应物低啊,比如自由基结合反应,过渡态是两个自由基对接过程中,由转动自由度向 振动自由度转化,导致的自由能的最高点,体系的electronic energy是单调递减的。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

8#
发表于 Post on 2015-5-7 05:36:55 | 只看该作者 Only view this author
Shannon 发表于 2015-5-6 23:39
Sob老师,过渡态能量似乎可以比反应物低啊,比如自由基结合反应,过渡态是两个自由基对接过程中,由转动 ...


我指的反应物是与过渡态直接相连的极小点而非最初的反应物,过渡态若不比反应物能量高就不可能是一阶鞍点。而且我这里说的能量是指电子能量,不是指自由能。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

127

帖子

1

威望

1231

eV
积分
1378

Level 4 (黑子)

9#
发表于 Post on 2015-5-7 23:00:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-5-7 05:36
我指的反应物是与过渡态直接相连的极小点而非最初的反应物,过渡态若不比反应物能量高就不可能是一阶鞍 ...

谢谢sob,另外有个问题想弄明白 自己理解的对不对,反应物和与过渡态直接相连的极小点是指 两个分子通过静电吸引力 吸到一块了的复合物吗? 也就是说,一般的 反应路径 电子能量是个N形或者W型,两个反应物接近的过程中能量先因为静电吸引力而降低,然后攀爬过渡态 能量上升,最后形成产物,能量再次下降?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112496

管理员

公社社长

10#
发表于 Post on 2015-5-8 02:33:41 | 只看该作者 Only view this author
Shannon 发表于 2015-5-7 23:00
谢谢sob,另外有个问题想弄明白 自己理解的对不对,反应物和与过渡态直接相连的极小点是指 两个分子通过 ...

是的

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-27 10:10 , Processed in 0.186622 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list