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[新手求助] 怎样寻找反应的中间体

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最近在学习搜寻过渡态,过渡态已经用TS方法进行搜寻,走的IRC为下图,该反应是SN2反应类型,想知道此反应是不是存在反应中间体,即怎样判断有没有中间体的存在,请高人指点。

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发表于 Post on 2018-8-10 18:03:41 | 只看该作者 Only view this author
对IRC两侧的结果进行优化,如果得到的结构一个对应反应物,一个对应产物,则说明没有中间体
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-8-10 21:14:49 | 只看该作者 Only view this author
对IRC两侧结果已经进行优化,左侧优化结果对应产物,右侧结果接近反应物,但是优化出现了一个-6.19的虚频,如果有反应中间体存在,优化中间体是不是应该没虚频?

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发表于 Post on 2018-8-10 23:37:10 | 只看该作者 Only view this author
xiaojingling016 发表于 2018-8-10 21:14
对IRC两侧结果已经进行优化,左侧优化结果对应产物,右侧结果接近反应物,但是优化出现了一个-6.19的虚频, ...

中间体是没有虚频的。-6.19的虚频太小了不可能是个过渡态,你用opt=tight应该就能消掉。

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发表于 Post on 2018-8-11 07:08:33 | 只看该作者 Only view this author
xiaojingling016 发表于 2018-8-10 21:14
对IRC两侧结果已经进行优化,左侧优化结果对应产物,右侧结果接近反应物,但是优化出现了一个-6.19的虚频, ...

Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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