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[新手求助] 关于氧化石墨烯层间距对结构优化问题

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各位老师我想问一下,对于各类计算软件来说多远的距离基本就不会有很明显的相互作用呢?,我想探究氧化石墨烯含氧官能团对层间距的影响,这个应该怎么去计算判断呢?我目前是通过改变含氧官能团种类去结构优化,但是好像发现我初始设置层间距多少,最后计算结构层间距基本就是多少,我层间距初始设置是按合成出来XRD判断的大概在8.3埃左右

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发表于 Post on 2024-9-27 23:41:30 | 只看该作者 Only view this author
距离多远作用不显著取决于作用类型,色散作用随距离收敛快(1/r^6),静电作用随距离收敛慢(1/r)。不清楚就做个势能面扫描
层间距一开始放得太远,有可能相互作用力太弱,导致刚开始就满足了几何优化的收敛判据。此时可以尝试放得近一些,比如距离等于原子范德华半径之和甚至更小一点点。8埃太远了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-28 13:40:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-27 23:41
距离多远作用不显著取决于作用类型,色散作用随距离收敛快(1/r^6),静电作用随距离收敛慢(1/r)。不清楚 ...

老师主要是我测的XRD层间距是8埃左右所以我设置的8埃左右,老师我看文献好像目前对于氧化石墨烯建模没有个标准,但是好像石墨烯层间距一般都用4埃左右而且层数会对电子结构有明显影响,那么比如说我计算初始构型也设置成4埃,最后他优化结果可能是6埃左右,和实际不一样,我可以用这个优化结构去评估多层氧化石墨烯的电子构型,和能带等一系列性质吗?

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发表于 Post on 2024-9-28 22:01:05 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2024-9-28 13:40
老师主要是我测的XRD层间距是8埃左右所以我设置的8埃左右,老师我看文献好像目前对于氧化石墨烯建模没有 ...

4埃的石墨层间距不可能优化到6埃去,除非你用的理论方法有问题,诸如不能合理描述色散作用
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-29 09:12:49 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-28 22:01
4埃的石墨层间距不可能优化到6埃去,除非你用的理论方法有问题,诸如不能合理描述色散作用

老师我是举个例子,我用模型不是单纯的石墨,是石墨上添加各类含氧官能团的氧化石墨烯,我的意思是我把初始多层氧化石墨烯的层间距调整到4埃左右,然后让他自己优化调节层间距,比如说最后他优化结果是6埃但是我实际XRD测出来的是8埃,那我还可以用我优化出来的这个模型去分析他的电子结构一些理化性质吗?因为我看很多文献目前对于多层氧化石墨烯的模型报道都很少,一些掺杂都是用单层石墨烯作为模型,我确定不了合适的氧化石墨烯模型

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发表于 Post on 2024-9-30 01:25:10 | 只看该作者 Only view this author
KCM@SHU 发表于 2024-9-29 09:12
老师我是举个例子,我用模型不是单纯的石墨,是石墨上添加各类含氧官能团的氧化石墨烯,我的意思是我把初 ...

我不知道XRD为什么能测出来8埃,要搞清楚两层之间到底隔了什么才导致那么大的空隙。计算模型必须能体现实际情况
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2024-9-30 08:28:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2024-9-30 01:25
我不知道XRD为什么能测出来8埃,要搞清楚两层之间到底隔了什么才导致那么大的空隙。计算模型必须能体现实 ...

老师好像氧化石墨烯的层间距普遍都是在8埃左右,但是目前氧化石墨烯的准确模型好像没有统一,而且大多文献里面都没有相关的多层氧化石墨烯的理论计算文章

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