Gromacs构建聚合物模型的问题

哆啦哆啦 · 发表于 Post on 2018-11-12 14:59:22

各位大佬，最近用gromacs的程序，构建聚合物，单体的力场文件有，该聚合物为AAAAAAAA,请问top 文件是自己手动将参数整合在一起吗？还是有其他办法

xiaowu759 · 发表于 Post on 2018-11-12 15:08:09

编辑rtp文件，用pdb2gmx生成即可，具体见GROMACS网上的资料文档

哆啦哆啦 · 发表于 Post on 2018-11-12 15:10:51

xiaowu759 发表于 2018-11-12 15:08
编辑rtp文件，用pdb2gmx生成即可，具体见GROMACS网上的资料文档

有没有资料可以分享一下

xiaowu759 · 发表于 Post on 2018-11-12 17:25:26

哆啦哆啦发表于 2018-11-12 15:10
有没有资料可以分享一下

哆啦哆啦 · 发表于 Post on 2018-11-12 17:43:39

xiaowu759 发表于 2018-11-12 17:25
http://www.gromacs.org/Documentation/How-tos/Polymers?highlight=polymer

谢谢您

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[综合交流] Gromacs构建聚合物模型的问题