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[新手求助] 做TD计算时可以用色散校正吗?怎样计算二聚体到溶液里会不会被破坏?

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在研究一个二聚体,做TD计算吸收光谱时可以用色散校正吗?该二聚体是通过氢键连接,怎样计算二聚体到溶液里会不会被破坏?

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发表于 Post on 2018-1-17 10:18:40 | 只看该作者 Only view this author
可以用,但对于垂直激发不会影响激发能,因为D3校正只依赖几何结构
计算溶液中二聚化过程的自由能变,越负越不容易被破坏(热力学角度),怎么算溶剂下的自由能看
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-17 12:06:14 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2018-1-17 10:18
可以用,但对于垂直激发不会影响激发能,因为D3校正只依赖几何结构
计算溶液中二聚化过程的自由能变,越负 ...

谢谢老师,二聚体的自由能-25kcal/mol左右,其单体的-16kcal/mol,这些值能直接判断会不会被破坏吗?是不是要搞一些二聚体再加一些溶剂分子建一个模型去跑个动力学再看看平衡后是个什么状态?跑动力学跑什么类型的,有什么建议吗?

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发表于 Post on 2018-1-17 13:48:10 | 只看该作者 Only view this author
风影月瞳 发表于 2018-1-17 12:06
谢谢老师,二聚体的自由能-25kcal/mol左右,其单体的-16kcal/mol,这些值能直接判断会不会被破坏吗?是不 ...

计算二聚体过程自由能变化
变化为负已经从热力学上说明能出现二聚(前提是计算级别合理)
做MD判断更为严格,但前提是力场合理
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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