计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 34709|回复 Reply: 25
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[ORCA] 推荐使用ORCA共享库版本

[复制链接 Copy URL]

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

ORCA程序体积太大一直为人所诟病,主要是用了静态库所致,Linux版ORCA4解压后体积高达11GB,压缩包也有2.2GB。
最近ORCA下载页面上放出了4.0.1.2版的共享库版本,我也加到了论坛的资源分享版的ORCA下载链接里了。共享库版本.tar.zst格式是166MB,.tar.xz格式是186MB。解压后才2.2GB,比G16 linux版都小得多。共享库版本运行速度和静态库版本实测完全一样,而且用起来不麻烦,把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中,然后就可以照常使用了。
一般就下.tar.xz的就行了,比较新的Linux系统直接就可以解压。.tar.zst用的是新兴的压缩率很高的Zstandard算法压缩的,解压需要额外装zstd程序(http://facebook.github.io/zstd/。下载预编译好的版本,然后用zstd -d orca_4_0_1_2_linux_x86-64_shared_openmpi202.tar.zst即可解压成.tar包)

评分 Rate

参与人数
Participants 7
eV +26 收起 理由
Reason
lishuo1997 + 4
gyg16 + 3 谢谢分享
一颗赛艇 + 3 好物!直接用7z压缩多好
尚艳磊 + 3 好物!
zsu007 + 5 好物!
alonewolfyang + 5 好物!
ahmadubuntu + 3

查看全部评分 View all ratings

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

286

帖子

3

威望

5609

eV
积分
5955

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2017-8-19 10:48:47 | 只看该作者 Only view this author
很好奇它到底用了什么静态库。。。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-19 13:58:23 | 只看该作者 Only view this author
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包还小一倍!
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

689

帖子

21

威望

5019

eV
积分
6128

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2017-8-19 17:57:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-19 13:58
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包 ...

都是水呀!

124

帖子

0

威望

1万

eV
积分
10498

Level 6 (一方通行)

5#
发表于 Post on 2017-8-19 18:06:00 | 只看该作者 Only view this author
看了一下,之前的Linux版占了11G的磁盘……

264

帖子

0

威望

2588

eV
积分
2852

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2017-8-20 00:05:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-19 13:58
有意思,我用7zip在1024MB词典下压缩,ORCA linux动态库版本竟然从2.01GB被压到了90MB,比Neese发布的zst包 ...

这么大词典,得占多少内存啊?!
一般为了减小压缩和解压时的内存占用,词典大小不会超过100M

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-20 14:04:16 | 只看该作者 Only view this author
Jasminer 发表于 2017-8-20 00:05
这么大词典,得占多少内存啊?!
一般为了减小压缩和解压时的内存占用,词典大小不会超过100M


压缩时约11GB内存,现在很多PC机都有16GB内存,实在不行再降点词典。
解压时需要的内存就更小了,1024MB词典只要有区区1GB内存就能解压,现在的PC没有满足不了的。
64MB词典压缩效果比1024MB词典差太远。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

65

帖子

0

威望

662

eV
积分
727

Level 4 (黑子)

8#
发表于 Post on 2017-8-30 15:45:05 | 只看该作者 Only view this author
sob老师好,您讲的“把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中”,是在那个文件中加呢?我以前用的4.0.0.2,没有进行这个设置就可以用,系统是Ubuntu,怎样设置呢?

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-30 20:45:19 | 只看该作者 Only view this author
wudazhuang509 发表于 2017-8-30 15:45
sob老师好,您讲的“把解压后的目录加到$LD_LIBRARY_PATH中”,是在那个文件中加呢?我以前用的4.0.0.2,没 ...


.bashrc
你以前用的是静态库版本,显然不需要设这个
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

65

帖子

0

威望

662

eV
积分
727

Level 4 (黑子)

10#
发表于 Post on 2017-8-30 20:50:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-30 20:45
.bashrc
你以前用的是静态库版本,显然不需要设这个

谢谢sob老师,我找到这个文件了,但是不知道您指的加一行是什么内容,论坛里面找了都试过了,好像都不可以,主要是不懂这个是什么意思,直接照抄别人的应该就不行了

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-8-30 21:12:00 | 只看该作者 Only view this author
wudazhuang509 发表于 2017-8-30 20:50
谢谢sob老师,我找到这个文件了,但是不知道您指的加一行是什么内容,论坛里面找了都试过了,好像都不可 ...

...
诸如你的目录是/home/sob,你就在/home/sob/.bashrc末尾加一行
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/home/sob/orca
就完了。然重新进入终端就能用了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

65

帖子

0

威望

662

eV
积分
727

Level 4 (黑子)

12#
发表于 Post on 2017-8-31 08:43:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-8-30 21:12
...
诸如你的目录是/home/sob,你就在/home/sob/.bashrc末尾加一行
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRAR ...

可以了 谢谢老师

28

帖子

0

威望

178

eV
积分
206

Level 3 能力者

13#
发表于 Post on 2017-10-10 19:47:57 | 只看该作者 Only view this author
谢谢sober,我下载的时候被(expert only!)吓到了

31

帖子

0

威望

242

eV
积分
273

Level 3 能力者

14#
发表于 Post on 2018-1-15 08:28:05 | 只看该作者 Only view this author
请问一下大家,我下载了zstd-v1.3.3-win64,解压后还是不能运行,改怎么使用呢?

$21R_EJS_SHEZ_`OLYY8FN9.png (8.57 KB, 下载次数 Times of downloads: 124)

$21R_EJS_SHEZ_`OLYY8FN9.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

15#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-1-15 10:12:47 | 只看该作者 Only view this author
anqingpingle 发表于 2018-1-15 08:28
请问一下大家,我下载了zstd-v1.3.3-win64,解压后还是不能运行,改怎么使用呢?


命令行下运行zstd -d [压缩包名字]
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 18:45 , Processed in 0.227924 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list