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[VMD] 用vmd搭建的水盒子序列号不连续,怎么使得序列号连续?

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请问用vmd搭建的水盒子序列号不连续,咋么使得序列号连续呢?

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发表于 Post on 2019-1-2 15:04:02 | 只看该作者 Only view this author
amber里面有个小程序fixatomorder可以修复顺序不连续问题,在cpptraj里面

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发表于 Post on 2019-1-2 16:10:18 | 只看该作者 Only view this author
试试这段命令:

set sel [atomselect top all]
$sel set resid [$sel get residue]
$sel writepdb renumbered.pdb

来源:http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/mailing_list/vmd-l/8479.html
我需要一些假日,但我不希望每天都是假日。因为我没有承担痛苦,因为那不是真正的自由。

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发表于 Post on 2019-1-2 18:58:00 | 只看该作者 Only view this author
gmx editconf转一下序号就顺了
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