计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9803|回复 Reply: 14
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 12个金原子的团簇用高斯计算时如何选择多重态?

[复制链接 Copy URL]

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
帮一个无机的老师计算他合成的含12个金的团簇,还含有有C、H、S 、P、N、Cl等元素,总原子数大约350个,他想得到HOMO LUMO Gap信息。
他已经测得晶体结构,我就用这个晶体结构,冻住重原子后对H进行限制性结构优化,方法和基组选择B3LYP/6-31G*/Lan2DZ(Au)(这也是他指定的).

因为测得的晶体结构中氯离子的无序比较严重,我想去掉氯离子,把这个团簇作为带两个正电荷的+2价正离子处理,想请教的是这种情况下多重态如何设置?是否应该仔细分析晶体结构,根据成键关系,找一下可能单电子,然后根据这个设定?



如果把两个氯加进去,变成中性,跟氢一起优化的话,是不是可以把多重态设置成1?

先谢谢各位了!

1043

帖子

0

威望

4188

eV
积分
5231

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2019-1-19 10:38:40 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
是什么晶体? 分子晶体,离子晶体还是共价晶体?

1043

帖子

0

威望

4188

eV
积分
5231

Level 6 (一方通行)

3#
发表于 Post on 2019-1-19 10:39:29 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
另外算gap用b3lyp有点靠不住

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 11:08:29 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-1-19 10:38
是什么晶体? 分子晶体,离子晶体还是共价晶体?

谢谢回复
应该是共价,但两个氯是阴离子。

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 11:10:06 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-1-19 10:39
另外算gap用b3lyp有点靠不住

应该是想大概说明一下分子稳定性和紫外光谱。我也不太懂,是他指定的。

230

帖子

0

威望

2665

eV
积分
2895

Level 5 (御坂)

6#
发表于 Post on 2019-1-19 11:11:56 | 只看该作者 Only view this author
金原子有一个单电子,金属金抗磁性,可以用自旋极化为一半金原子指定+7自旋多重度,另一半指定-7试试

1043

帖子

0

威望

4188

eV
积分
5231

Level 6 (一方通行)

7#
发表于 Post on 2019-1-19 11:12:55 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
Tanya 发表于 2019-1-19 11:08
谢谢回复
应该是共价,但两个氯是阴离子。

用第一性原理模拟可能更靠谱些

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 11:56:48 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-1-19 11:12
用第一性原理模拟可能更靠谱些

可能是发文章的时候审稿人提出让他算算看。

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 13:15:14 | 只看该作者 Only view this author
一颗赛艇 发表于 2019-1-19 11:11
金原子有一个单电子,金属金抗磁性,可以用自旋极化为一半金原子指定+7自旋多重度,另一半指定-7试试

谢谢回复!
不太理解怎么指定+7和-7 多重度?我是用Gaussian计算的。具体应该怎么设置呢?

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125137

管理员

公社社长

10#
发表于 Post on 2019-1-19 20:27:39 | 只看该作者 Only view this author
B3LYP本来算HOMO-LUMO gap就是公认很适合的,再加上此泛函描述此体系本来也没有问题,用B3LYP计算不用担心什么。

看去掉氯离子之后体系的电子数,是奇数的话自旋多重度设2,是偶数的话自旋多重度设1,为保险起见,建议同时加上stable关键词以自动检测此自旋多重度是否是基态自旋多重度(如果测试结果提示stable就没问题)。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

11#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 21:16:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-19 20:27
B3LYP本来算HOMO-LUMO gap就是公认很适合的,再加上此泛函描述此体系本来也没有问题,用B3LYP计算不用担心 ...

谢谢卢老师!我明白了。

有两个结构要算,电子数都为偶数,第一个我昨天设置多重度为1,SCF无法收敛,设置为3后可以算完。等下我再加入stable测试一下波函数稳定性。另外一个多重度设置为1,正在正常优化中,算完后也测一下。

听你的课时你讲过stable关键词,还给你了

1043

帖子

0

威望

4188

eV
积分
5231

Level 6 (一方通行)

12#
发表于 Post on 2019-1-19 22:04:07 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-19 20:27
B3LYP本来算HOMO-LUMO gap就是公认很适合的,再加上此泛函描述此体系本来也没有问题,用B3LYP计算不用担心 ...

看什么体系吧。我曾用B3LYP算过一些体系,跟实验差了好几个eV。

70

帖子

1

威望

439

eV
积分
529

Level 4 (黑子)

13#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-19 23:00:07 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-1-19 22:04
看什么体系吧。我曾用B3LYP算过一些体系,跟实验差了好几个eV。

请问,后来你用什么程序计算的呢?

1043

帖子

0

威望

4188

eV
积分
5231

Level 6 (一方通行)

14#
发表于 Post on 2019-1-20 00:42:44 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
Tanya 发表于 2019-1-19 23:00
请问,后来你用什么程序计算的呢?

换pbe就好些

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125137

管理员

公社社长

15#
发表于 Post on 2019-1-20 02:13:41 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-1-19 22:04
看什么体系吧。我曾用B3LYP算过一些体系,跟实验差了好几个eV。

HOMO-LUMO gap不是实验可测的,不存在严格对比方式

多数情况,纯泛函算gap明显偏低。

看这里的测试http://bbs.keinsci.com/thread-3000-1-1.html,是实验可测的带隙和理论计算对比,可以推广到孤立体系的实验不可测的HOMO-LUMO gap计算上。B3PW91表现良好,因此与之HF成份一致的B3LYP也半斤八两。当计算HOMO-LUMO gap只考虑一个泛函时,显然适合使用最流行、对当前体系也稳妥的B3LYP而不是PBE。用B3LYP导致审稿人问为啥不用PBE的几率远远低于用PBE时审稿人问为啥不用B3LYP的几率。

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-20 15:39 , Processed in 0.159305 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list