计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 6530|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[VASP] VAPS模拟还原过程求助

[复制链接 Copy URL]

9

帖子

0

威望

499

eV
积分
508

Level 4 (黑子)

请问大家,如何在VASP中模拟还原过程呢?比如针铁矿的还原其实是得到了一个电子,这样就会使得体系带一个负电荷,需要吸附一个H+以保持电中性,就相当于计算的时候直接向表面加一个H原子,这样可以吗?

1万

帖子

0

威望

9851

eV
积分
22085

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2020-9-7 11:04:10 | 只看该作者 Only view this author
可以,但是要搞清楚吸附的是H+还是Na+、K+等其他阳离子
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

254

帖子

0

威望

1143

eV
积分
1397

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2020-9-8 00:37:10 | 只看该作者 Only view this author
不清楚你想研究的是还原过程的什么问题,是哪个原子的失电子还是?
努力挖掘科学的本质

9

帖子

0

威望

499

eV
积分
508

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-8 08:43:24 | 只看该作者 Only view this author
Penson 发表于 2020-9-8 00:37
不清楚你想研究的是还原过程的什么问题,是哪个原子的失电子还是?

您好,首先感谢您的回复。比如说研究水溶液中针铁矿的还原促进铁的解离过程,目前想到的研究思路是模拟表面上一个铁先还原再解离,这个还原的的过程就是Fe(III)通过某种方式,像微生物的还原,得到了一个电子到Fe(II),那么怎么把这个还原后的针铁矿表面模拟出来呢?(以及,索大真的太帅了!)

9

帖子

0

威望

499

eV
积分
508

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-9-8 08:46:27 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-9-7 11:04
可以,但是要搞清楚吸附的是H+还是Na+、K+等其他阳离子

谢谢您,请问水溶液中含有少量的金属阳离子(Ca2+、Mg2+、Na+等)是否可以在模拟的过程中忽略呢?

1万

帖子

0

威望

9851

eV
积分
22085

Level 6 (一方通行)

6#
发表于 Post on 2020-9-8 10:02:07 | 只看该作者 Only view this author
hu_jh 发表于 2020-9-8 08:46
谢谢您,请问水溶液中含有少量的金属阳离子(Ca2+、Mg2+、Na+等)是否可以在模拟的过程中忽略呢?

应该不能忽略,尤其是Ca2+和Mg2+,表面还原带了负电荷以后,这些高价金属离子没准会在表面矿化。
不过为了简便起见,可以先用Na+把问题研究清楚以后,再考虑高价金属离子。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

254

帖子

0

威望

1143

eV
积分
1397

Level 4 (黑子)

7#
发表于 Post on 2020-9-9 09:54:35 | 只看该作者 Only view this author
hu_jh 发表于 2020-9-8 08:43
您好,首先感谢您的回复。比如说研究水溶液中针铁矿的还原促进铁的解离过程,目前想到的研究思路是模拟表 ...

我觉得,这个化学过程,要看反应实际上反应前后,是否有原子数量的改变,如果有,这可以加上相应增加的带正电的原子作为末态;而如果没有(或者反应后体系非中性而带电),就可以考虑研究一下电荷密度差的问题,在输入文件修改电子的数量,重新做单点计算,再和原来的默认电子的单点做电荷差
努力挖掘科学的本质

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-18 03:23 , Processed in 0.179710 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list