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[新手求助] ONIOM自定义基组求助

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本帖最后由 yundove 于 2019-3-9 16:15 编辑


各位老师好,请问在使用ONIOM计算时,怎么进行自定义基组输入?我试算了一个例子,下面是输入文件。
%NProcShared=24
%Mem=12GB
# oniom(qcisd(t)/cc-pvdz:m062x/gen)

Title Card Required

0 1 0 1 0 1
C                0   -4.17102978    0.46247818    0.00000000 L
H                0   -3.81435694    0.96687637    0.87365150 L
H                0   -3.81435694    0.96687637   -0.87365150 L
H                0   -5.24102978    0.46249136    0.00000000 L
C                0   -3.65771407   -0.98945397    0.00000000 L H 8
H                0   -4.01438509   -1.49385152    0.87365262 L
H                0   -4.01438879   -1.49385337   -0.87365004 L
C                0   -2.11771407   -0.98947218   -0.00000377 H
H                0   -1.58453936   -0.06177356   -0.00000576 H
O                0   -1.48421519   -2.07678526   -0.00000452 H

-H     0
S   3   1.00
     34.0613410              0.60251978E-02   
      5.1235746              0.45021094E-01   
      1.1646626              0.20189726      
S   1   1.00
      0.32723041             1.0000000        
S   1   1.00
      0.10307241             1.0000000        
P   1   1.00
      0.8000000              1.0000000               
****
-C     0
S   6   1.00
  13575.3496820              0.22245814352E-03      
   2035.2333680              0.17232738252E-02      
    463.22562359             0.89255715314E-02      
    131.20019598             0.35727984502E-01      
     42.853015891            0.11076259931   
     15.584185766            0.24295627626   
S   2   1.00
      6.2067138508           0.41440263448   
      2.5764896527           0.23744968655   
S   1   1.00
      0.57696339419          1.0000000        
S   1   1.00
      0.22972831358          1.0000000        
S   1   1.00
      0.95164440028E-01            1.0000000        
S   1   1.00
      3.1721480009E-02           1.0000000
P   4   1.00
     34.697232244            0.53333657805E-02      
      7.9582622826           0.35864109092E-01      
      2.3780826883           0.14215873329   
      0.81433208183          0.34270471845   
P   1   1.00
      0.28887547253          1.0000000        
P   1   1.00
      0.10056823671          1.0000000        
P   1   1.00
      3.3522745570E-02       1.0000000
D   1   1.00
      1.09700000             1.0000000        
D   1   1.00
      0.31800000             1.0000000        
F   1   1.00
      0.76100000             1.0000000               
****
-O     0
S   6   1.00
  27032.3826310              0.21726302465E-03      
   4052.3871392              0.16838662199E-02      
    922.32722710             0.87395616265E-02      
    261.24070989             0.35239968808E-01      
     85.354641351            0.11153519115   
     31.035035245            0.25588953961   
S   2   1.00
     12.260860728            0.39768730901   
      4.9987076005           0.24627849430   
S   1   1.00
      1.1703108158           1.0000000        
S   1   1.00
      0.46474740994          1.0000000        
S   1   1.00
      0.18504536357          1.0000000        
S   1   1.00
      6.1681787857E-02     1.0000000
P   4   1.00
     63.274954801            0.60685103418E-02      
     14.627049379            0.41912575824E-01      
      4.4501223456           0.16153841088   
      1.5275799647           0.35706951311   
P   1   1.00
      0.52935117943          1.0000000        
P   1   1.00
      0.17478421270          1.0000000        
P   1   1.00
      5.8261404233E-02     1.0000000
D   1   1.00
      2.31400000             1.0000000        
D   1   1.00
      0.64500000             1.0000000        
F   1   1.00
      1.42800000             1.0000000        
****



M06-2X计算使用的基组是ma-TZVP(直接从https://comp.chem.umn.edu/basissets/ma-TZVP.gbs拷贝过来的)
在对高层进行DFT计算时会报错(已附上输出文件),不知道是什么原因,烦请各位老师帮忙解答,谢谢!



2_gen_m06_1.log

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发表于 Post on 2019-3-9 16:18:25 | 只看该作者 Only view this author
你当前的计算设定毫无意义
qcisd(t)/cc-pvdz完全是用来当做典型反面教材的计算级别,结果精度还没你本来要用的低层好
就这么点体系还用ONIOM,完全是自找麻烦,还由于对层之间的耦合考虑不充分导致降低精度,完全不是该用ONIOM的场合
直接用和ma-TZVP大小相仿佛的may-cc-pVTZ就完了,省得你自定义基组
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-9 16:24:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-9 16:18
你当前的计算设定毫无意义
qcisd(t)/cc-pvdz完全是用来当做典型反例的计算级别,结果精度还没你本来要用的 ...

感谢sob老师的回复!我刚接触ONIOM,想先在小体系下试算一下,然后再用到大分子体系。现在这样的方法设置是有问题,之后会用ccsd(t)/cbs做高层计算。我只是想知道这样设置能不能计算成功。参照您的http://sobereva.com/60感觉这样设置应该是能跑通的,但是为什么计算会报错呢?

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发表于 Post on 2019-3-9 16:30:14 | 只看该作者 Only view this author
yundove 发表于 2019-3-9 16:24
感谢sob老师的回复!我刚接触ONIOM,想先在小体系下试算一下,然后再用到大分子体系。现在这样的方法设置 ...

把输入文件作为附件传上来
而且别用G09 A.01这么老的版本,bug一大堆
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-9 16:33:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-9 16:30
把输入文件作为附件传上来

已上传,麻烦sob老师了!

2_gen_m06_1.gjf

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发表于 Post on 2019-3-10 05:57:50 | 只看该作者 Only view this author
yundove 发表于 2019-3-9 16:33
已上传,麻烦sob老师了!

普通计算时某些设定能用、设置方式合理,不代表结合ONIOM的时候就能正常用

当前情况应该算是Gaussian的bug,没法正确对低层级别正确读入自定义基组设定。改用质量和大小相仿佛的6-311+G(2df,p),或者may-cc-pVTZ亦可(后者给更贵点)
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Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-3-10 13:50:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-3-10 05:57
普通计算时某些设定能用、设置方式合理,不代表结合ONIOM的时候就能正常用

当前情况应该算是Gaussian ...

好的,非常感谢sob老师!!

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