求助高浓度离子npt失败

亮剑匹夫 · 发表于 Post on 2019-4-28 17:00:10

最近用gromacs加入高浓度MgCl2(2M,4M)的时候，用genion命令无法加入，显示没有足够溶剂。于是我就用packmol加，然后能量最小化总是出现not be settled或者让我检查错误连接或者缩小步长的问题，即使成功生成steep.gro最后npt也总是报错，求解答。感谢各位大佬

少年爱吃地三鲜 · 发表于 Post on 2019-4-28 18:21:36

新用户要加求助哦，新用户守则，快点改掉吧，一会老师说你了

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-29 04:27:55

优化过程时候使用柔性水，此时不牵扯settle算法，也就不会报错

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[GROMACS] 求助高浓度离子npt失败