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[波函数分析求助] 求助,关于Hirshfeld surface图的问题

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本帖最后由 枕上卢生 于 2019-6-30 15:01 编辑

今天第一次接触Hirshfeld surface图,请问一下各位老师,我做了PCl3和C2(CN)4的Hirshfeld surface图,为什么只出现一个平面?而没有将选定的分子包裹起来。另外,最近第一次投稿有回音了,小修,但是有一个审稿人给的意见如下(Comment 4: The values in MEP are general Mulliken charges, which are very accurate. I suggest author to calculate the Hirshfeld population.),小弟刚接触量化没多久,还希望各位老师指教,审稿人希望我计算Hirshfeld population??怎么计算啊?

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发表于 Post on 2019-6-30 16:16:12 | 只看该作者 Only view this author
你考察的对象不是晶体当中(或者团簇内部)的一个分子,显然surface不会包围整个分子。Multiwfn手册里的例子也是如此。你明白原理自然就懂了。
仔细看下文,有更多讨论
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html

问出“The values in MEP are general Mulliken charges”这种问题的人肯定缺乏波函数分析的基本常识,这问题本身在概念上就是错误。静电势和原子电荷在概念上完全就是两码事。

Hirshfeld原子电荷用Multiwfn算,例子看Multiwfn手册4.7.1节
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-6-30 16:40:14 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 枕上卢生 于 2019-6-30 16:41 编辑

谢谢sob老师啦,那我该如何回复审稿人呢?

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发表于 Post on 2019-6-30 18:36:44 | 只看该作者 Only view this author
枕上卢生 发表于 2019-6-30 16:40
谢谢sob老师啦,那我该如何回复审稿人呢?

给他科普什么叫静电势和原子电荷。如果你算了静电势,说明你算静电势是基于实际电子密度的,不是基于原子电荷近似算的,所以和原子电荷也扯不上关系
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-1 08:26:19 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-6-30 18:36
给他科普什么叫静电势和原子电荷。如果你算了静电势,说明你算静电势是基于实际电子密度的,不是基于原子 ...

好的好的,太感谢sob老师了

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