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[粗粒化/DPD] 粗粒化模拟折叠温度问题

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楼主
最近刚开始学习用粗粒化模型模拟蛋白质domain movement,在wang-landou模拟前为了更好的学习偏置势,先模拟了蛋白的折叠温度,大概流程就是在设定的范围里二分法选择温度并长时间MD模拟(检查了确实足够长),看native-contact的平均数目是否超过一半,结果得到的折叠温度大概是460K左右,实验得到的tm是333K,看软件示例里的蛋白变性温度也是390K,所以这个力场是不是需要换或者粗粒化这种精度也是可以接受的?软件用的是cafemol,力场用的是软件内置的一个go-like的模型,native-state选的是核磁得到的pdb

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