利用multiwfn获得.inp文件，在orca中运行报错问题

dongdong · 发表于 Post on 2020-6-30 20:10:15

这两天安装了ORCA，成功运行的简单的test.inp(如图)，自己认为安装成功了，但是通过Multiwfn获得H2O.inp(如图)，在orca中运行出现如图错误，是我软件没有安装成功还是核数关键词的设置问题呢？

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-30 20:12:34

输入文件没问题。先尝试串行计算看能否成功，能的话可能MPI库有问题。
另外注意并行核数不要超过物理核数

dongdong · 发表于 Post on 2020-6-30 20:44:19

sobereva 发表于 2020-6-30 20:12
输入文件没问题。先尝试串行计算看能否成功，能的话可能MPI库有问题。
另外注意并行核数不要超过物理核数

谢谢卢老师。刚才试了下穿行是没有问题的，关于MPI库的问题，我运行mpiexec -V得到版本号。对于路径是按照老师那个的步骤来的，所以不知道到底出错在哪里。

sobereva · 发表于 Post on 2020-6-30 21:33:06

换成最新版ORCA再试

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-1 10:53:55

本帖最后由 dongdong 于 2020-7-1 10:59 编辑

sobereva 发表于 2020-6-30 21:33
换成最新版ORCA再试

昨天尝试用openmpi314 和orca421，按照之前一样的安装，发现运行后一样的报错，所以我开始怀疑是不是由于我多次安装导致系统某些地方弄错了，于是在电脑虚拟机也尝试了，还是这样报错。
ORCA finished by error termination in GTOInt
Calling Command: mpirun -np 4 ./orca_gtoint_mpi H20.int.tmp H20
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
.... aborting the run
再试试静态版的orca，看看行不行。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-1 20:27:25

dongdong 发表于 2020-7-1 10:53
昨天尝试用openmpi314 和orca421，按照之前一样的安装，发现运行后一样的报错，所以我开始怀疑是不是由于 ...

这和动态还是静态的没关系
远程说不清楚。实在不行就装个虚拟机或者通过WSL用linux版ORCA

naonao5205 · 发表于 Post on 2020-7-1 21:50:08

本帖最后由 naonao5205 于 2020-7-1 21:51 编辑

可能是linux换行符和win10下不一样导致的
我改换行的脚本

#! /bin/bash
for inf in *.inp
do
echo doing ${inf}
time sed -i 's/\r//' ${inf}
echo ${inf} done
done

复制代码

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-1 22:54:27

naonao5205 发表于 2020-7-1 21:50
可能是linux换行符和win10下不一样导致的
我改换行的脚本

谢谢您的回复！应该不是输入文件的问题，只要并行就会报错，穿行就可以。所以怀疑是MPI库或者ORCA 的问题，但是前面已经讲到OPENMPI安装正确，二ORCA安装也解压加个路径就可以了。所以不知道这样报错的问题出在哪。

thanhtam · 发表于 Post on 2020-7-1 22:57:01

which mpirun看看呢？

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-2 11:31:41

thanhtam 发表于 2020-7-1 22:57
which mpirun看看呢？

谢谢回复！之前试过了，在指定的目录下。

rabbitkiller · 发表于 Post on 2020-7-2 16:03:54

换个不是root的账户试试看呢？

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-2 22:19:19

rabbitkiller 发表于 2020-7-2 16:03
换个不是root的账户试试看呢？

谢谢您的回复，最后发现不能再root下安装。

teller3531 · 发表于 Post on 2020-8-31 19:12:09

dongdong 发表于 2020-7-2 22:19
谢谢您的回复，最后发现不能再root下安装。

您好遇到和您一样的问题
您说的最后发现不能再root下安装是指orca不能装在root下还是openmpi那，谢谢了

dongdong · 发表于 Post on 2020-9-2 15:50:53

teller3531 发表于 2020-8-31 19:12
您好遇到和您一样的问题
您说的最后发现不能再root下安装是指orca不能装在root下还是openmpi那，谢谢了

不能再root下运行，

wzkchem5 · 发表于 Post on 2020-9-3 20:19:54

并行计算调用orca时应该用绝对路径，如果通过定义$PATH的方式，orca可能没有办法在正确的文件夹里寻找orca_gtoint_mpi程序。比如从你的Calling Command输出看，orca尝试在你的输入文件所在的目录下调用orca_gtoint_mpi，结果没找到，这个可能就是报错的原因

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[ORCA] 利用multiwfn获得.inp文件，在orca中运行报错问题

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