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[NBO相关] 求助nbo7计算服务器多核并行方法

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楼主
我们课题组在服务器上安装了nbo7,使用的脚本./gennbo.sh提交的任务,
但是这样只能调用一个服务器的核心,怎么才能使得gennbo这个任务多核并行

./gennbo.sh的脚本如下
#!/bin/bash


#  Set environment variables:

export JOB=/home/jiao/nbo7/yingduo
export NBOFIL=$1
export NBODTL=$2


#  Locate the NBO7 binaries directory:


export NBOBIN=/home/jiao/nbo7/bin


#  Set INT manually (to i4 or i8):


export INT=i8


#  Identify executables:


export NBOEXE=$NBOBIN/nbo7.$INT.exe
export GENEXE=$NBOBIN/gennbo.$INT.exe


#  Ensure that executables exist:


if [ ! -e $NBOEXE ]
  then
    echo "NBO executable is missing in the $NBOBIN directory"
  exit
fi
if [ ! -e $GENEXE ]
  then
    echo "GenNBO executable is missing in the $NBOBIN directory"
  exit
fi


#  Delete the old output file, if it exists:


if [ -e $JOB.nbo ]
  then
    rm -i $JOB.nbo
fi
if [ -e $JOB.nbo ]
  then
    exit
fi

($GENEXE $JOB.47 > $JOB.nbo) >& /dev/null &


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发表于 Post on 2019-7-15 11:35:43 | 只看该作者 Only view this author
我没听说过NBO能并行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-15 15:51:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-15 11:35
我没听说过NBO能并行

那就完全靠单核性能了是么 ? 好的 谢谢您老师

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发表于 Post on 2019-7-15 20:19:25 | 只看该作者 Only view this author
心辉 发表于 2019-7-15 15:51
那就完全靠单核性能了是么 ? 好的 谢谢您老师

本来NBO的绝大部分分析耗时就不高,是否并行化意义不大,主要也就是NRT分析很耗时。速度只看单核性能
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-16 09:02:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-15 20:19
本来NBO的绝大部分分析耗时就不高,是否并行化意义不大,主要也就是NRT分析很耗时。速度只看单核性能

嗯嗯  好的  谢谢您

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