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[其它程序] 组装体二级结构分析

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在Gromacs上跑出了一个由双亲性短肽分子(端基被非肽有机分子保护的短肽分子)组装成的纳米结构,然后想利用DSSP统计该纳米结构中存在的二级结构,由于分子中的非肽片段无法被DSSP识别,请问怎么才能得到这种情况下的二级结构信息呢?谢谢!

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发表于 Post on 2016-12-28 13:46:27 | 只看该作者 Only view this author
用VMD看看能否判断出二级结构。能的话,用自带的timeline插件就可以绘制各个残基二级结构随时间的变化图
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