计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 582|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 高斯几何优化报错slurmstepd: error: Detected 11 oom-kill event(s) in StepId=85...

[复制链接 Copy URL]

77

帖子

0

威望

433

eV
积分
510

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
希望老师们帮忙看看是否有什么不合适的地方,同样的关键词试了别的分子不会报错,但是构建的这个分子总是报错说内存不足。感谢各位老师!

报错信息:
slurmstepd: error: Detected 11 oom-kill event(s) in StepId=8539903.batch. Some of your processes may have been killed by the cgroup out-of-memory handler.
输入文件信息:
%nprocshared=32
%mem=96GB
%chk=O2-C+L-double.chk
# opt freq b3lyp scrf=(smd,solvent=water) tzvp

O2-C+L-double

0 2
O                  2.54081600   -0.47460800    0.45132300
O                  2.06433200   -2.53578900   -0.40922500
O                  5.35730000    1.71037100   -0.46051800
O                  2.14468700   -0.07114400   -2.40637000
O                  2.31233200   -1.49370800    3.11463000
O                  0.81481900   -3.92610100    3.24757800
O                  1.31219200   -5.81992900    1.10045000
O                  3.13228100    2.44983000   -3.28280000
O                  5.69686700    3.25861000   -2.11438300
O                  5.98273900    1.29961900    2.28514700
O                  2.53212000   -4.17058700   -2.69869300
C                  3.55877900    0.07801400   -0.40312200
C                  2.87160600    0.81694800   -1.55893500
C                  2.61539600   -1.84712600    0.71038900
C                  4.43114000    1.04527200    0.41353900
C                  1.71721600   -3.66998600    2.16995500
C                  1.27925100   -4.40406600    0.89789300
C                  3.87125300    1.65450900   -2.35742300
C                  2.14068500   -3.96532700   -0.29181500
C                  4.71137600    2.53459100   -1.42686000
C                  5.26400600    0.35899200    1.48125300
C                  1.67089300   -4.53882300   -1.61574600
H                  4.18212800   -0.72446500   -0.80793500
H                  2.12229400    1.48940700   -1.13442400
H                  3.65809000   -2.16262800    0.84810000
H                  3.78209800    1.79278700    0.88555900
H                  2.72059200   -4.03046900    2.43864900
H                  0.23485900   -4.16176200    0.69125300
H                  3.18394200   -4.26066500   -0.11731200
H                  4.55671900    0.98539700   -2.89384200
H                  4.08137400    3.27487400   -0.92445000
H                  5.95421200   -0.34764300    1.00852000
H                  4.61283700   -0.18841500    2.15968600
H                  0.64519400   -4.21034300   -1.81242600
H                  1.68384500   -5.62603800   -1.56492900
H                  2.75723500   -0.73534900   -2.75444800
H                  3.20181500   -1.83269500    3.29095800
H                  0.76994200   -4.88515100    3.36439400
H                  2.22702600   -6.08442700    1.27608900
H                  3.76205000    2.89254400   -3.86732700
H                  6.21493700    2.64345000   -2.65529600
H                  6.57687100    1.79066700    1.70201300
H                  2.50660500   -3.20743000   -2.77997800
O                 -3.15353100    3.34403300   -0.23914500
O                 -3.99659900    1.45267500    1.64506100
O                 -4.93757900    2.61372500   -2.37061100
O                 -3.27016400   -3.40062400    0.07511200
O                 -2.76345000    4.00174200    2.29578500
O                 -5.72449900   -4.01726600   -0.94616200
C                 -3.36266600    1.96383400   -0.65361100
C                 -4.44496000    1.39045200    0.28003100
C                 -4.79653300   -0.04268200   -0.04145400
C                 -3.70881400    1.91458000   -2.12949000
C                 -3.86535400   -1.06960200    0.13951500
C                 -6.05930100   -0.36900300   -0.53165800
C                 -1.87798100    3.72613100    0.13271100
C                 -4.18552300   -2.38425900   -0.16283200
C                 -6.38863400   -1.68436700   -0.84355000
C                 -5.45595000   -2.70013100   -0.66387200
C                 -1.67475600    4.11105100    1.47017100
C                 -0.83088600    3.78874100   -0.77540000
C                 -0.41960800    4.55987100    1.87275300
C                  0.42769800    4.22897900   -0.36725300
C                  0.62608500    4.61690900    0.95145400
C                 -2.44284500   -3.72896600   -1.05969900
C                 -2.59632300    4.30464300    3.68890100
H                 -2.43455700    1.40683900   -0.50676700
H                 -5.34336900    2.00283500    0.16849700
H                 -2.89420200    2.37247300   -2.69657900
H                 -3.79383700    0.86865800   -2.43737000
H                 -2.87667300   -0.86017000    0.52943700
H                 -6.79934300    0.40955100   -0.67166600
H                 -3.70307300    2.36334500    1.83185100
H                 -7.37546100   -1.93193800   -1.21851000
H                 -1.00836200    3.49578200   -1.80249700
H                 -5.10160500    2.59753600   -3.32160200
H                 -0.24891500    4.85977100    2.89696400
H                  1.23984700    4.27380600   -1.08145700
H                  1.59765300    4.96670100    1.27747100
H                 -6.62313000   -4.09304600   -1.29717200
H                 -1.82831700   -4.57445600   -0.75802800
H                 -3.05481400   -4.01139700   -1.91906800
H                 -1.80492700   -2.88256800   -1.32416100
H                 -2.32206700    5.35187600    3.82807300
H                 -1.84275200    3.65743400    4.14169000
H                 -3.56460600    4.11711600    4.14636400
O                  2.97282652   -2.50270966   -4.74625514
O                  3.04380443   -1.34393804   -4.70720364
O                  1.79212900   -2.15730600    1.96513900



最大节点数 无限制
最大CPU核数 2560 核
最大DCU卡数 40 卡
最大运行作业数 200 个
处理器2*AMD 7702 64C
内存256GB DDR4
计算网络100Gb OPA



5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112373

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2024-5-14 08:04:52 | 只看该作者 Only view this author
输入文件本身没问题
咨询管理员
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 20:59 , Processed in 0.270418 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list