请教老师们量化软件中内坐标的表示形式

Markmahao

各位老师好，      我看有些书上写的笛卡尔坐标到内坐标变换方法为：S=B*X，其中B是变换矩阵，X是笛卡尔坐标，S是内坐标。所以请问各位老师，这个公式里面的S和我们常见的内坐标的格式是一样的吗？还是需要做单位变化？因为矩阵的正确形式没见过，能否给一个小分子的例子？十分感谢！


例如水分子：
O              
H                  1    0.96000000
H                  1    0.96000000    2  109.49999976

它的S是啥样的呢？

wzkchem5

可以变化单位，也可以不变化。只要S和B、X的单位统一即可

sobereva

看J. Chem. Phys., 117, 9160 (2022)，里面写得很详细。注意并不是S=B*X，而是δS=B*δX，内坐标和笛卡尔坐标之间不是线性变换关系。

Markmahao

wzkchem5 发表于 2022-5-13 14:45
可以变化单位，也可以不变化。只要S和B、X的单位统一即可

谢谢老师！

Markmahao

sobereva 发表于 2022-5-14 00:17
看J. Chem. Phys., 117, 9160 (2022)，里面写得很详细。注意并不是S=B*X，而是δS=B*δX，内坐标和笛卡尔坐 ...

谢谢sob老师，我去查看一下那篇文章。