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[新手求助] 求助核磁计算是否对坐标修改设置

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老师,计算芳香族的还有对坐标进行鬼原子设置,那么计算其他分子核磁是否需要同类设置,还是使用原分子坐标直接加NMR关键词就可以?

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发表于 Post on 2019-10-24 00:00:21 | 只看该作者 Only view this author
你不去算NICS、ICSS就完全不牵扯鬼原子,对于芳香类化合物和普通化合物都一样
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-24 15:10:46 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzy 于 2019-10-24 20:38 编辑
sobereva 发表于 2019-10-24 00:00
你不去算NICS、ICSS就完全不牵扯鬼原子,对于芳香类化合物和普通化合物都一样

1.谢谢老师,算出来四甲基硅烷的iso,但是σisoH的数值都不一样,是取平均数?还是怎么选?2.
%nproc=32
%chk=1.chk
%mem=1GB
#p B3LYP/6-31G(d,p) opt freq EmpiricalDispersion=GD3BJ scrf(CPCM,solvent=water) pop=NBO NMR

T

0 1
C                  3.36193113    1.94101185    1.93679980
H                  2.56129937    4.43630064    2.81221298
N                  3.15938526    3.24015089    1.22796590
O                  2.89577746    1.67187790    3.01508285
N                  4.38574561    1.11603245    1.22796590
C                  3.94942106    3.30154135    0.00000000
C                  4.75806957   -0.00000000    1.75321903
这样写可以不,老师,同时计算水相下的核磁和NBO?

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发表于 Post on 2019-10-26 04:28:21 | 只看该作者 Only view this author
wzy 发表于 2019-10-24 15:10
1.谢谢老师,算出来四甲基硅烷的iso,但是σisoH的数值都不一样,是取平均数?还是怎么选?2 ...

先确保初始结构满足Td点群再说,否则肯定有可查觉的数值误差导致轻微破坏等价性

强烈不建议用CPCM,这里说了
谈谈隐式溶剂模型下溶解自由能和体系自由能的计算
http://sobereva.com/327http://bbs.keinsci.com/thread-3345-1-1.html

NMR和NBO可以
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-26 12:35:33 | 只看该作者 Only view this author
嗯,谢谢老师,知道了,请教老师怎么画好看的核磁图

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发表于 Post on 2019-10-27 01:15:27 | 只看该作者 Only view this author
wzy 发表于 2019-10-26 12:35
嗯,谢谢老师,知道了,请教老师怎么画好看的核磁图

gview画出来,然后导出曲线数据,导入到origin之类程序里,恰当设置就好看了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-10-28 20:07:40 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzy 于 2019-10-28 20:35 编辑
sobereva 发表于 2019-10-27 01:15
gview画出来,然后导出曲线数据,导入到origin之类程序里,恰当设置就好看了

老师,使用NMR计算出gview导出origin中和TMS求差后要归一化0-10作为横坐标?

TIM图片20191028195459.png (19.71 KB, 下载次数 Times of downloads: 34)

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wzy 发表于 2019-10-28 20:07
老师,使用NMR计算出gview导出origin中和TMS求差后要归一化0-10作为横坐标?

病句,看不懂
弄成和gview显示的一样的就完了
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